Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -2 -4 -4 -5 -3 -3 -4 -5 -4 2 1 -4 6 -2 -4 -3 -2 -4 -3 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 4 0 34 0 0 0 0 0 0 53 0.95 0.62 2 S 3 -2 -1 -3 -3 -3 -3 -3 -4 -4 -5 -3 -4 -5 -3 5 3 -5 -2 -3 24 1 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56 16 0 1 0 1.01 1.17 3 T 3 -4 -2 0 2 -2 -1 -3 -1 -3 -4 -2 -3 -5 -4 2 4 -5 -4 1 22 0 1 6 4 1 4 1 2 0 0 2 0 0 0 13 32 0 0 12 0.58 1.25 4 R -2 1 2 0 -5 2 2 3 -1 -6 -6 0 -5 -6 2 1 -2 -6 -5 -5 2 7 12 6 0 9 13 25 1 0 0 6 0 0 10 9 1 0 0 0 0.55 1.35 5 K 0 3 -1 -2 -5 1 -2 -1 -2 -5 -4 5 -4 -3 1 -2 -3 -1 2 -4 7 16 3 1 0 6 1 4 0 0 1 42 0 1 6 2 1 1 7 1 0.71 1.38 6 A -1 6 0 -3 -6 -1 -2 -4 -2 -3 -4 5 -2 -5 -4 -3 -3 -6 -5 -2 4 42 4 1 0 1 1 1 1 2 1 37 1 0 0 0 1 0 0 3 1.11 1.44 7 V -1 -2 -3 -5 -4 0 -4 -6 -5 4 0 -4 0 -2 -5 -3 0 -6 -4 5 4 3 1 0 0 5 1 0 0 22 5 0 2 1 0 2 5 0 0 50 0.91 1.47 8 I -2 -5 -4 -5 -4 -4 -5 -6 -6 5 0 -5 -1 -1 -5 -2 -3 -5 -2 5 3 0 1 0 0 1 0 0 0 33 7 0 0 2 0 3 1 0 1 48 1.12 1.49 9 G 0 -6 -4 -5 7 -5 -5 6 -5 -5 -5 -5 -3 -6 -5 -3 -4 -6 -6 -3 7 0 0 0 27 0 0 63 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 1.74 1.51 10 Y -2 -3 -3 -5 -4 -2 -4 -5 0 -4 -3 -4 -4 0 -5 1 -2 -1 9 -4 4 1 1 0 0 1 0 0 1 0 1 1 0 1 0 10 2 0 77 0 1.94 1.52 11 Y 0 -4 -5 -5 -5 -3 -4 -4 0 -3 -2 -4 -3 6 -5 -1 -3 0 7 -3 9 0 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 0 30 0 4 1 1 47 1 1.44 1.47 12 F 0 -2 -1 -1 -3 -2 1 -1 -2 -2 -2 -2 -2 3 0 -1 3 1 3 -1 9 2 3 3 0 2 10 5 1 2 3 2 1 13 6 4 18 2 12 5 0.29 1.15 13 I 0 -2 0 0 -2 1 -1 1 -1 0 -2 0 0 -3 -2 3 0 -3 -2 1 7 2 5 4 1 7 4 10 1 6 4 6 3 1 2 22 5 0 1 9 0.17 1.08 14 P -1 0 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 1 -1 -2 -1 2 -1 -1 9 -1 -1 5 5 3 2 1 2 2 4 1 2 12 3 1 2 10 5 4 32 1 5 0.87 0.98 15 T 1 1 1 -1 -1 0 -1 1 -2 -2 -2 -1 2 -1 -1 1 1 -2 -1 0 12 8 6 4 1 4 3 11 1 3 4 3 5 2 2 11 9 1 2 8 0.11 0.91 16 N -1 -1 0 1 6 0 -2 -2 -2 0 -1 -1 -1 -2 -2 -1 0 3 -2 1 6 4 5 7 20 4 2 4 1 6 5 4 1 1 2 3 7 4 1 12 0.36 0.98 17 Q -1 -2 -1 -2 -2 0 -1 1 -1 -2 -1 1 -2 0 -2 -1 -1 -1 7 -1 4 2 3 2 1 4 4 10 1 2 5 7 1 2 2 5 3 1 36 4 0.58 0.98 18 I 0 0 -1 -1 1 -1 -2 0 -2 0 0 0 0 4 -2 -1 -1 1 3 1 7 5 3 3 3 3 3 7 1 5 7 5 2 15 2 3 5 2 9 9 0.17 1.00 19 N 0 1 2 -1 -3 -1 -2 1 -1 -3 -2 -2 -2 -1 -2 2 4 -3 -1 0 6 7 8 4 1 2 2 10 2 1 3 2 1 2 2 16 23 0 2 6 0.30 1.16 20 N -2 -2 5 -1 0 0 -2 0 -1 -3 -3 -2 -3 -1 -2 0 0 -3 4 -3 3 1 33 3 2 4 2 8 1 1 3 2 1 2 2 8 7 0 13 2 0.56 1.20 21 Y -2 -3 -3 -3 -2 -1 -3 -1 -1 -3 -1 -3 -1 3 -3 -3 -2 10 3 -2 2 2 1 2 1 3 1 5 1 1 5 2 2 11 1 2 3 41 10 3 1.40 1.22 22 T 3 1 -1 -2 -3 -1 -2 0 -2 -2 -3 -2 -2 -3 1 2 0 0 0 -1 28 8 2 2 0 2 2 7 1 2 2 1 1 1 7 18 6 1 3 5 0.32 1.24 23 E 0 -1 -1 -1 -3 4 3 -3 -1 2 -2 -1 -1 -2 0 -1 -1 1 -2 1 8 2 3 3 0 18 18 2 1 10 3 4 2 2 4 5 4 2 1 9 0.28 1.31 24 T -3 -2 -2 -2 -4 -3 -1 1 -1 -2 -2 -3 -2 -1 -3 0 -2 7 7 -3 2 2 2 2 0 1 4 10 1 2 3 1 1 1 1 7 3 17 38 1 1.06 1.35 25 D -2 5 -1 2 -3 0 -2 3 -2 -4 -1 -1 -3 -4 -4 -1 -3 2 -2 -4 3 37 2 10 1 3 2 20 1 1 6 2 0 1 1 5 1 3 1 1 0.66 1.36 26 T 0 1 -1 -1 -2 1 -2 0 -2 1 -1 -1 -2 -2 4 0 0 -2 -2 1 6 7 3 3 1 6 3 8 1 8 5 3 1 2 19 6 6 0 1 12 0.22 1.27 27 S -1 -1 1 0 -2 -2 -1 3 -1 -3 -3 1 -2 -2 -1 0 0 0 4 -2 4 3 6 6 1 1 4 25 1 1 3 8 1 1 3 7 5 1 16 2 0.37 1.21 28 V -1 -1 1 2 3 0 0 1 1 0 -1 -1 -1 -1 1 -1 0 -2 -2 1 4 3 7 10 7 4 5 11 3 4 6 3 1 2 6 3 6 1 2 10 0.12 1.21 29 V 0 4 0 -2 -2 0 -2 3 -1 -1 -2 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -3 -2 -1 8 21 3 2 1 4 2 26 2 4 5 2 1 3 1 5 3 0 1 4 0.35 1.26 30 P 0 1 2 -1 -2 1 -1 0 -2 -3 -2 3 -2 -3 2 1 -1 -4 -3 -2 6 7 11 4 1 5 3 6 1 2 4 22 1 1 12 9 3 0 1 2 0.33 1.28 31 F -2 -3 -3 -2 -1 -3 -3 -3 -1 -1 -1 -3 1 6 -3 -3 -3 3 6 -3 3 1 1 3 1 1 1 2 1 3 6 2 4 37 1 1 2 3 26 1 1.00 1.28 32 P 0 -2 1 1 -3 0 -1 -1 2 -3 0 0 1 0 2 -1 2 0 0 -1 6 2 6 8 0 5 4 5 5 1 9 6 3 4 9 4 12 1 4 5 0.11 1.26 33 V -1 -3 -3 -3 -2 -3 -2 -3 -3 2 0 -3 -1 -1 5 -2 -2 -3 -3 3 4 1 1 1 1 1 2 2 1 12 7 1 1 3 32 2 2 0 1 24 0.71 1.24 34 S 0 1 0 3 -4 0 3 -1 -1 -3 -3 1 0 -3 -2 1 -1 -2 -2 -3 6 8 5 14 0 4 19 5 1 1 3 9 3 1 2 10 4 1 2 2 0.29 1.28 35 N -2 -1 5 5 -4 0 0 -3 1 -3 -3 0 -2 -3 -2 -1 -2 -4 -1 -4 3 3 27 29 0 4 6 1 3 1 3 6 1 1 2 3 2 0 2 1 0.70 1.33 36 I -2 -4 -4 -4 -3 -4 -4 -4 -3 6 1 -4 1 1 -2 -4 -2 -4 -2 3 3 1 1 1 0 1 1 1 1 47 10 1 3 6 2 1 1 0 1 19 0.90 1.37 37 T -1 -1 1 5 -3 2 0 -2 -2 -2 -2 -1 -3 -3 0 0 2 -3 -3 -2 4 3 7 32 1 8 4 3 1 2 4 2 1 1 4 6 12 0 1 4 0.47 1.12 38 P -1 -1 -1 1 -2 -1 -1 -2 -2 -1 -2 0 -2 -3 5 2 -2 -3 -2 -2 4 3 3 8 1 3 5 3 1 3 5 5 1 1 34 14 2 0 1 3 0.57 1.06 39 A 0 -2 -1 -1 2 0 -1 1 0 0 1 -1 -1 2 -2 -1 0 -2 0 -1 9 2 3 4 5 4 4 11 3 7 12 4 1 8 2 5 6 1 3 4 0.07 0.93 40 K -1 -2 -2 1 -3 2 -2 -2 -2 -2 2 -1 -2 -3 5 0 -1 -3 -3 -2 4 2 2 8 0 9 2 2 1 2 21 3 1 1 30 7 3 0 1 2 0.56 1.22 41 A 3 -3 -3 -3 6 -2 -3 0 -3 0 0 -3 -2 -1 -3 -1 0 3 -1 1 28 1 1 1 15 1 1 6 0 4 10 1 0 2 1 3 5 5 3 11 0.47 1.25 42 K 0 -1 2 4 -3 1 1 -1 0 -4 -3 0 -3 -2 0 2 -1 -4 -3 -3 6 2 8 21 0 7 9 5 2 1 2 6 0 2 6 19 2 0 1 1 0.38 1.29 43 Q -2 -1 2 0 -4 1 -2 -3 1 -1 2 4 0 0 -3 -1 -3 -3 0 -2 3 3 10 4 0 6 2 2 3 3 19 27 2 4 1 4 1 0 3 3 0.34 1.31 44 L -3 -4 -4 -4 7 -4 -4 -4 -3 2 4 -4 -1 1 -4 -3 -3 -3 2 0 1 1 1 1 22 1 1 1 0 10 36 1 1 5 1 2 1 0 7 6 0.83 1.33 45 T -3 -4 -1 -2 -4 -3 -4 -4 -4 -4 -4 -3 -4 -5 -4 2 7 -5 -4 -3 0 0 2 2 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 12 81 0 0 0 1.65 1.55 46 H -4 -3 -2 -2 -6 -1 -3 -5 11 -5 -5 -3 -4 -3 -4 -4 -3 -5 -1 -4 1 0 0 2 0 1 0 0 89 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 1 2.71 1.57 47 I -1 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 5 4 -5 0 -3 -5 -5 -4 -5 -4 3 4 0 0 0 0 0 0 0 0 38 35 0 1 0 0 0 0 0 0 20 1.14 1.58 48 N -4 -4 4 -4 -2 -3 -5 -5 1 4 2 -4 -1 1 -6 -3 -2 -5 0 2 1 1 23 0 1 1 0 0 3 29 17 0 1 6 0 1 2 0 3 12 0.72 1.61 49 F -5 -5 -5 -6 2 -5 -5 -6 0 -2 -2 -5 -4 4 -6 -5 -5 0 9 -3 0 0 0 0 4 0 0 0 2 2 2 0 0 18 0 0 0 1 71 1 2.11 1.61 50 S 5 -3 -2 -4 -2 -4 -4 2 -5 -5 -5 -4 -4 -5 -4 3 -1 -6 -5 -3 58 1 1 0 1 0 0 17 0 0 0 0 0 0 0 18 2 0 0 1 1.09 1.61 51 F -5 -6 -5 -7 -2 -6 -6 -6 -3 -2 -2 -6 -3 9 -5 -5 -5 -2 3 -4 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 89 0 0 0 0 6 0 2.40 1.62 52 L 5 -5 -5 -5 -3 -4 -4 1 -5 2 0 -4 1 0 -5 -2 -2 -5 -4 2 46 0 0 0 0 0 0 12 0 12 7 0 4 5 0 2 1 0 0 12 0.72 1.62 53 D -2 -3 4 1 -5 -3 -1 4 1 -3 -3 -2 -3 -3 0 0 0 1 -3 -2 2 1 20 9 0 0 3 29 3 1 2 3 0 1 6 6 7 2 1 4 0.52 1.63 54 I -3 -5 -6 -6 -4 -4 -6 -6 -6 5 2 -5 4 1 -4 -4 -1 -5 -4 4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 36 17 0 10 5 1 0 3 0 0 26 1.04 1.63 55 N -2 2 4 4 -4 1 -2 -1 -1 -5 -5 0 -5 -4 -5 1 2 -2 -2 -2 3 11 22 22 0 5 2 4 1 0 0 4 0 1 0 9 12 1 1 3 0.60 1.61 56 S 2 -2 3 1 -5 -2 2 -2 -2 -3 -5 0 -5 -5 4 2 -2 -6 -3 -4 16 2 14 7 0 1 13 3 1 1 1 4 0 0 20 14 2 0 1 0 0.56 1.60 57 N -2 -3 4 6 -5 -1 1 0 -1 -5 -5 -1 -5 -6 -3 0 -1 -6 -3 -5 2 1 21 43 0 3 6 6 1 0 1 3 0 0 1 7 3 0 1 0 0.95 1.57 58 L -2 -2 1 -3 -3 1 0 4 -1 -3 -2 0 -3 2 -4 -1 2 -4 1 -3 2 1 6 1 0 6 6 34 1 1 4 5 0 8 0 4 14 0 4 1 0.47 1.51 59 E -2 -1 0 0 -1 0 1 -1 0 1 -1 2 -2 -2 -4 1 3 -1 1 -1 3 3 4 5 1 4 8 4 2 9 6 11 1 1 0 11 18 1 5 4 0.18 1.50 60 C -2 -2 -3 0 0 -1 -1 -4 -1 3 1 0 0 -1 -4 -2 -2 -5 -2 4 3 2 1 5 2 3 5 1 1 14 11 6 2 3 1 2 2 0 1 34 0.43 1.51 61 A 0 -1 -1 0 -4 0 -1 -3 0 1 -1 0 1 -1 -1 2 1 -5 -2 2 8 4 3 5 0 4 3 1 2 8 4 7 3 2 4 17 9 0 1 15 0.17 1.50 62 W -2 -2 -2 -4 -4 -1 -3 -1 -1 2 1 -1 0 3 -3 0 -1 6 1 0 2 2 2 1 0 2 2 6 1 14 14 5 2 14 1 7 3 11 5 6 0.39 1.46 63 D -2 -1 2 4 -3 0 1 0 3 -1 -1 -1 -2 -2 -1 0 -1 -5 -2 -1 3 2 9 24 0 3 9 7 8 3 6 3 1 2 3 8 3 0 1 5 0.32 1.46 64 P 0 -3 -1 5 -4 -1 0 -1 -1 0 -1 -2 -2 -3 3 0 -1 -2 -4 -1 6 1 2 34 0 2 6 5 2 6 7 2 1 1 12 5 4 1 0 4 0.48 1.42 65 A 0 -3 1 2 -4 -1 1 -2 -3 -2 -3 -1 -3 -3 1 1 0 5 1 0 9 1 5 11 0 2 11 3 0 2 3 4 0 1 8 13 7 7 5 6 0.26 1.42 66 T 0 -2 0 -1 -4 -1 -1 0 -2 -3 0 -1 -2 -3 1 0 3 7 1 -3 7 2 4 4 0 3 4 6 1 1 9 4 1 1 7 6 16 18 4 2 0.46 1.47 67 N 0 -2 4 4 -5 -2 -1 -2 -1 -3 -3 -2 1 -3 -2 0 0 7 0 -3 9 2 18 20 0 1 4 2 1 1 2 2 3 0 2 7 5 15 4 1 0.62 1.51 68 D -1 -3 3 5 -5 -1 1 -3 -1 -3 0 -1 -1 -3 -1 0 -1 -5 -4 -2 5 1 13 32 0 2 10 2 1 2 9 4 1 1 3 7 3 0 0 4 0.51 1.51 69 A 0 -1 1 4 -3 2 1 -1 -2 -1 -3 -2 -3 -2 -1 0 -1 1 -3 1 9 3 6 20 0 11 10 5 1 3 3 1 0 2 3 5 3 2 1 13 0.28 1.46 70 K -2 -1 2 0 -4 0 0 -1 -2 -1 -2 1 -3 -2 3 -1 0 3 2 -1 3 4 11 6 0 4 6 4 1 3 4 8 0 1 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