Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 T 2 -3 2 -2 -3 -2 -2 -2 -3 -5 -5 -2 -4 -5 -3 6 0 -5 -4 -4 12 0 8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 77 2 0 0 0 1.15 0.94 2 W -5 -5 -6 -7 -5 -5 -6 -6 -3 -1 -2 -5 -3 5 -6 -4 -5 10 6 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 2 0 0 19 0 1 0 40 32 3 2.11 1.36 3 G 1 -2 1 -2 -5 1 4 1 -2 -5 -4 -1 -4 -3 -3 2 1 1 -4 -3 12 1 6 1 0 5 27 12 1 0 1 3 0 1 1 17 10 2 0 1 0.47 1.40 4 V -3 -5 -6 -6 -4 -1 -5 -6 -6 2 3 -5 4 0 -6 -5 -3 -5 -4 5 1 0 0 0 0 3 0 0 0 11 28 0 9 3 0 0 0 0 0 45 1.03 1.52 5 S -4 -1 -1 0 -5 5 1 -5 0 -4 -5 0 -4 -1 -5 2 3 2 2 -3 0 3 3 4 0 31 7 0 2 1 0 5 0 3 0 15 17 3 6 1 0.69 1.59 6 S 0 -3 -3 -4 -5 4 -3 -3 2 -1 -1 -3 1 -5 -1 3 1 -5 -1 2 6 0 1 0 0 19 0 1 6 3 6 0 4 0 3 25 9 0 2 15 0.49 1.60 7 P -4 -4 -4 -2 -6 2 -2 -5 -5 -6 -6 -4 -5 -7 8 -1 -2 -7 -6 -6 0 1 0 2 0 11 2 0 0 0 0 0 0 0 78 5 2 0 0 0 2.24 1.64 8 K 1 1 -3 -2 -6 3 3 -2 -2 -6 -5 2 -5 -6 4 0 -2 -4 -3 -4 10 6 0 2 0 12 22 3 1 0 1 13 0 0 20 6 1 0 1 1 0.65 1.67 9 N -1 -3 -2 2 -5 0 2 -3 1 -2 -3 -1 -4 -3 -2 5 1 -6 -5 -1 4 0 1 10 0 4 15 1 3 2 2 3 0 1 2 40 8 0 0 4 0.59 1.68 10 V -3 -5 -6 -6 -2 -3 -5 -6 -6 3 3 -5 3 -3 -3 -5 -4 -5 -4 5 1 0 0 0 1 1 1 0 0 14 29 0 6 0 1 0 0 0 0 46 1.10 1.68 11 Q -2 0 -3 -3 1 0 -2 -5 1 -1 -3 -1 0 0 -3 4 4 -5 2 -1 2 6 0 1 3 5 3 0 3 4 1 3 2 4 1 28 23 0 7 5 0.47 1.72 12 G 4 -3 -5 -5 -4 -5 -3 2 -6 -1 -2 -3 -3 -5 -5 -1 -2 -6 -5 5 30 1 0 0 0 0 1 17 0 1 3 1 0 0 0 3 2 0 0 40 0.85 1.72 13 L 1 -3 -3 -3 -5 5 -1 -5 -2 0 0 -3 0 -1 0 1 -1 4 -4 1 11 0 1 1 0 24 4 0 1 4 9 1 2 3 5 13 3 6 0 11 0.45 1.72 14 S -2 -3 0 -2 -6 0 5 -5 -4 -4 -1 0 -1 -4 3 -2 -3 -6 -3 0 3 1 5 0 0 4 46 0 0 0 8 5 1 0 13 3 1 0 1 8 0.78 1.74 15 G -2 -4 -3 -3 -1 -5 -4 7 -3 -7 -7 -5 -6 -7 -5 -3 -5 -6 -6 -6 2 1 1 1 1 0 1 93 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.17 1.74 16 S 1 -3 -3 1 -5 4 0 0 -3 -4 1 -2 0 -4 -5 3 2 -6 -5 -4 11 1 0 7 0 16 6 7 1 0 13 2 2 1 0 21 11 0 0 0 0.41 1.74 17 C -1 0 1 1 7 -2 -2 -4 -3 -1 -5 -3 -2 -4 -3 3 3 -3 -2 -4 4 5 7 9 23 1 2 1 1 5 0 1 1 0 1 20 18 0 2 0 0.77 1.76 18 L 2 -6 -6 -6 -4 -5 -5 -5 -6 3 -1 -5 -1 -3 -4 -2 -2 -6 -5 6 15 0 0 0 0 0 0 1 0 14 5 0 1 1 0 4 2 0 0 58 1.13 1.77 19 L -2 2 -2 -1 -5 -2 0 -5 3 1 0 -2 -3 0 -5 1 4 2 -3 0 2 11 1 3 0 2 6 0 6 7 9 2 0 4 0 12 25 3 0 7 0.39 1.77 20 I -4 -6 -6 -7 -4 -6 -6 -7 -6 5 4 -6 1 -1 -6 -4 -4 -5 -4 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33 45 0 2 2 0 1 0 0 0 16 1.21 1.77 21 P -2 -1 2 -1 -3 -2 -2 -4 -2 -5 -4 -1 -5 -4 6 2 0 -6 -2 -5 2 4 12 3 0 1 2 1 1 0 2 3 0 1 45 16 6 0 1 0 1.07 1.78 22 C -4 -7 -6 -7 11 -6 -7 -6 -6 -4 -4 -6 -5 0 -6 -4 -4 -5 -5 -4 0 0 0 0 94 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 0 0 3.42 1.77 23 I -2 0 1 -4 -2 0 -3 -3 0 -3 -3 0 -4 -3 -4 4 5 -5 -2 -2 1 5 7 0 1 4 1 1 3 1 2 4 0 1 0 30 35 0 1 3 0.73 1.69 24 F -3 -3 -4 -5 -4 -4 -4 -1 -3 -2 0 -4 -2 7 -5 -4 -3 -2 5 -1 1 2 1 1 0 1 1 5 0 2 9 1 1 48 1 1 1 0 22 4 1.28 1.57 25 S -2 -2 0 0 -4 0 -1 -1 0 -1 -3 -1 -3 -1 -3 5 1 1 1 -3 2 2 4 5 0 3 4 4 2 4 2 4 0 3 1 44 7 2 5 1 0.54 1.53 26 Y -1 -1 0 -1 -3 -2 -2 -2 1 0 -2 -2 -2 2 -1 2 1 -2 5 -1 5 3 4 4 1 1 2 3 3 5 3 2 1 9 3 17 8 0 22 4 0.39 1.29 27 P -1 -3 -2 0 1 -2 0 -1 -3 -3 -3 -1 -3 -2 6 2 -1 -2 -2 -2 3 1 2 6 3 2 5 4 1 1 3 4 1 2 36 18 3 1 1 3 0.71 1.33 28 A 1 0 -1 0 -3 1 1 -2 2 -1 -2 0 1 -3 0 1 0 5 -1 -1 12 4 2 6 0 5 8 4 4 3 4 5 4 1 4 12 5 9 2 5 0.20 1.36 29 D -2 0 1 3 -3 0 1 0 1 -1 -3 -1 -3 0 0 1 -1 -1 -1 -2 3 6 7 19 0 5 9 8 3 4 3 4 1 4 5 9 5 1 2 3 0.21 1.32 30 V -1 0 -1 -1 -3 -1 -2 1 2 0 0 0 -2 0 -2 1 0 3 1 1 5 4 3 4 0 3 3 10 5 6 11 6 1 4 2 11 6 3 4 8 0.08 1.40 31 P 0 0 1 -1 -4 -1 -1 0 -2 -3 -1 0 -2 -1 2 0 1 7 1 -2 9 6 6 4 0 3 4 7 1 1 6 5 1 3 10 6 8 12 5 3 0.30 1.53 32 V 0 -1 -1 2 -4 -3 -3 -2 -2 1 -2 -1 -3 1 2 0 1 -2 3 1 9 4 3 10 0 0 2 2 1 9 4 4 0 5 9 6 9 1 10 12 0.19 1.65 33 S -1 -1 -1 1 -4 -1 -3 0 -2 -1 0 0 -2 -1 1 3 1 0 2 -3 4 4 2 7 0 2 1 8 1 3 11 5 1 2 7 24 9 1 8 1 0.24 1.67 34 N 0 0 3 3 -4 -2 -2 1 -1 -3 -3 0 -4 -2 1 1 2 -5 -3 -2 6 6 13 15 0 2 2 11 1 2 2 5 0 2 8 10 11 0 1 2 0.30 1.64 35 G -1 -1 2 1 -1 -1 -2 2 -2 -4 -1 0 -1 -2 3 2 0 -2 -3 -3 6 4 8 8 1 3 2 13 1 1 8 5 2 2 14 14 6 1 1 2 0.22 1.53 36 I 0 -2 1 -2 -1 -1 -2 -4 1 1 1 -3 2 0 -1 -2 0 -1 3 2 9 2 6 2 1 3 3 1 3 7 14 2 6 3 3 3 7 1 9 16 0.19 1.52 37 T -2 0 0 0 -4 -2 -3 -2 4 -2 -2 -3 -1 0 0 1 2 -3 5 -2 3 6 3 6 0 1 1 3 9 3 4 1 1 4 4 13 15 0 17 3 0.38 1.59 38 A 0 -3 -3 -4 -2 -4 -2 2 -4 3 1 -3 0 2 -4 -2 -1 -4 -2 3 9 1 1 1 1 1 2 15 0 14 13 1 2 7 1 3 4 0 1 22 0.37 1.56 39 I -1 -1 -3 -3 0 0 -2 -2 3 0 -1 -1 0 4 -2 1 0 -2 4 -1 6 4 1 1 2 4 2 3 7 6 5 4 2 16 2 10 5 0 15 3 0.32 1.59 40 W -4 -4 -6 -7 -5 -4 -3 -3 -3 -6 -4 -4 -5 -1 -4 -3 -5 12 0 -4 1 1 0 0 0 1 2 3 0 0 1 1 0 1 1 2 0 85 1 1 3.53 1.79 41 Y -4 -1 -1 -5 -5 -3 -2 -1 1 -1 -2 -5 -2 4 -6 -4 -4 2 8 -3 1 4 4 0 0 1 3 5 3 4 4 0 1 18 0 1 1 3 48 2 1.26 1.77 42 Y -4 5 -1 -5 -6 5 -3 -5 -1 -5 -3 2 -1 2 -5 -2 -3 4 2 -4 1 31 2 0 0 24 1 0 1 0 2 12 1 9 0 2 1 6 6 1 0.95 1.81 43 D -2 0 0 3 -3 6 1 0 1 -4 -4 -1 -4 0 -2 -3 -3 3 -2 -4 2 4 4 16 0 33 10 8 3 1 2 3 0 4 2 1 1 4 1 1 0.68 1.81 44 Y -2 1 0 -1 -6 -1 0 1 4 -3 -2 3 -2 1 0 -1 -2 -1 3 -3 3 8 4 3 0 3 6 12 10 2 5 16 1 5 5 3 2 1 11 2 0.31 1.81 45 S 0 -4 0 0 -5 -1 0 1 2 -4 -4 0 -5 -4 5 1 1 -6 -5 -1 7 0 3 6 0 2 5 9 5 1 1 5 0 1 29 12 9 0 0 5 0.58 1.80 46 G -2 -2 1 1 -2 -1 -2 5 -3 -5 -6 -1 -5 -1 0 1 0 -5 0 -5 2 2 7 8 1 2 2 43 0 0 0 4 0 3 5 10 5 0 3 1 0.68 1.79 47 K -2 2 -1 -1 -2 2 3 1 1 -1 -2 3 -1 -4 0 -1 1 -6 -3 -4 3 11 2 3 1 8 16 9 3 4 3 16 1 1 4 3 10 0 1 1 0.32 1.77 48 R 2 2 1 1 1 0 -1 1 -2 -3 -4 1 1 1 1 1 -2 -5 -1 -3 14 10 8 8 3 4 3 11 1 1 1 7 3 6 6 9 2 0 3 2 0.20 1.74 49 Q -2 -3 -2 1 -5 2 0 -2 -2 -2 -2 -2 0 -2 6 0 -1 -5 -3 -1 3 1 2 7 0 10 6 4 1 2 5 2 2 2 38 7 4 0 1 4 0.73 1.67 50 V 0 -3 -3 -3 -4 0 -1 -2 -1 2 1 0 -3 2 2 -1 0 -5 -1 2 8 1 1 2 0 5 5 3 2 13 13 5 0 7 9 5 6 0 2 14 0.20 1.67 51 V -3 -1 -2 -5 -3 -3 -4 -6 -1 3 1 -4 -1 1 -2 -2 -1 -4 4 4 1 4 2 0 1 1 1 0 2 17 14 1 1 5 2 3 3 0 12 30 0.60 1.70 52 I 2 -5 -5 -3 -4 -5 -3 -2 -2 1 2 -4 1 2 -5 -1 -2 -4 5 2 18 0 0 1 0 0 2 3 1 8 16 1 3 7 0 4 2 0 17 16 0.49 1.74 53 H 0 -1 0 -1 -5 -2 -3 -3 4 1 -2 -3 0 3 -2 0 2 -4 3 -1 7 4 5 4 0 2 2 1 9 8 4 1 2 13 2 8 14 0 11 4 0.33 1.75 54 S -2 0 5 0 -2 -3 -2 -3 1 -2 -3 1 -4 -2 -5 3 2 1 1 -4 2 4 29 5 1 0 2 2 4 3 2 8 0 1 0 19 11 2 5 1 0.57 1.73 55 G -1 -2 4 0 -5 -1 -1 3 1 1 -3 0 -1 -2 -1 0 1 -6 -4 -3 5 2 22 4 0 2 4 18 3 7 2 6 1 2 3 6 10 0 0 2 0.37 1.72 56 D -2 3 1 3 -5 0 1 -1 -1 -4 -1 1 -4 -2 2 -1 -1 -2 -1 -3 4 18 7 14 0 4 8 6 1 1 6 6 0 2 11 5 3 1 2 2 0.31 1.72 57 P 1 -1 -2 2 -5 -1 -1 -1 -3 -3 -2 1 -4 -5 5 1 0 -5 -1 -3 11 4 1 13 0 3 3 5 1 2 4 9 0 0 24 9 7 0 2 2 0.44 1.69 58 K -2 3 1 -1 -5 2 0 0 0 -3 -2 2 -2 -5 -2 2 -1 -2 -1 -2 2 18 7 4 0 9 4 7 2 2 4 12 1 0 2 16 2 1 2 3 0.33 1.65 59 L -2 1 0 1 -5 0 1 2 0 -2 -1 2 0 0 2 0 -2 -5 -3 -2 3 7 5 6 0 4 10 15 3 2 6 10 3 4 9 7 2 0 1 3 0.18 1.66 60 V -2 -2 -2 -2 -1 3 0 -2 -4 1 -1 -1 0 -2 -2 -1 1 -4 0 4 2 2 2 3 1 13 5 3 0 8 6 3 2 1 2 5 9 0 3 29 0.34 1.54 61 D -2 0 0 1 -4 1 2 -1 4 -2 -2 1 0 -1 1 1 -1 -2 0 -2 3 5 5 6 0 7 12 4 9 3 3 9 3 2 7 12 4 0 3 3 0.20 1.55 62 K -1 -1 1 3 -3 -1 3 0 -1 -4 -3 1 -1 -1 2 0 -1 0 -3 -4 4 3 7 14 1 2 21 8 2 1 3 10 1 3 9 6 3 2 1 1 0.34 1.57 63 R -1 3 -1 0 -4 1 4 0 2 -4 -4 1 -3 -1 -1 1 -2 -4 -4 -2 4 16 2 5 0 5 25 6 4 1 2 8 1 4 3 10 2 0 0 2 0.40 1.57 64 F -1 -3 -4 -4 -4 -3 -2 -4 -1 1 -2 -1 -1 6 -3 -2 3 -2 4 -1 5 2 1 1 0 1 2 1 1 7 3 4 1 35 1 2 17 0 13 3 0.78 1.52 65 R -2 3 -1 -1 -5 4 0 -4 1 -5 -5 4 -3 -5 1 2 -2 -5 -4 -3 2 17 3 4 0 16 4 1 3 0 1 21 1 0 6 18 1 0 0 2 0.61 1.62 66 G -2 -3 1 1 -5 -2 0 6 -4 -3 -3 -1 -4 -5 -1 -2 -1 2 -5 -5 2 1 5 7 0 2 8 53 0 2 2 3 0 0 4 2 4 3 0 0 0.85 1.42 67 R -2 7 -3 -4 -5 -1 -3 -4 -3 -2 -3 2 -4 -5 -1 -1 -2 -5 -4 -4 2 69 0 0 0 2 0 0 0 3 3 8 0 0 3 5 3 0 0 0 1.37 1.41 68 A -1 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -3 -4 0 1 -2 0 6 -4 -1 0 -3 2 2 6 1 0 1 0 0 1 2 0 5 11 3 2 38 1 6 7 0 5 12 0.71 1.36 69 E -1 1 0 -3 -4 2 1 -3 3 -1 -3 -1 -3 0 -3 2 2 0 -1 0 4 7 4 1 0 9 11 1 8 3 2 3 0 4 1 18 13 1 2 6 0.30 1.31 70 L -1 -4 -4 -4 -3 -3 -4 -1 -4 0 3 -4 1 3 -1 -1 -3 5 1 0 6 1 1 1 0 1 1 5 0 6 34 1 3 13 4 6 1 7 4 6 0.47 1.28 71 M -1 0 0 -1 -4 1 -4 -5 1 1 2 -1 1 1 -1 0 1 3 0 -1 4 4 5 4 0 6 0 0 3 8 20 4 3 5 4 8 10 3 3 4 0.18 1.82 72 G -2 -1 0 -4 1 1 -2 3 2 -1 0 0 1 1 -5 -1 -1 3 0 -1 3 3 4 0 3 7 3 22 4 3 11 5 4 7 0 5 4 4 3 4 0.25 1.86 73 N -3 -2 5 5 -5 -1 -1 -2 -2 -4 -5 -1 -5 -2 -4 1 -1 -1 -3 -4 1 1 31 35 0 2 3 3 1 1 0 4 0 2 0 11 3 1 1 1 0.92 1.37 74 M -3 -2 -3 -4 -4 -2 -1 -3 0 2 1 2 -1 -2 4 1 -1 2 -3 -1 1 1 1 0 0 1 4 1 2 13 13 12 1 2 23 13 3 3 1 5 0.42 1.28 75 D 0 2 0 0 -5 2 0 0 -1 -3 -1 2 -1 -4 -2 2 1 0 -3 -3 7 11 4 5 0 10 5 7 1 2 5 11 1 1 1 18 8 1 1 1 0.25 1.40 76 H 0 2 1 1 -3 2 1 1 1 -3 -3 1 -1 -4 -2 2 0 0 -4 -4 7 11 7 6 0 10 9 11 3 1 3 8 2 0 2 14 4 1 0 1 0.26 1.40 77 K -3 2 4 -1 -5 1 -1 2 1 -5 -4 4 -4 -5 -4 -1 0 -5 -1 -4 1 9 22 2 0 5 3 13 4 0 1 24 0 0 0 4 7 0 3 1 0.57 1.36 78 V -2 -2 5 4 -5 0 -1 -2 0 -4 -5 -1 -1 -5 -4 2 1 -5 0 -2 2 2 28 21 0 4 2 2 2 1 0 4 2 0 0 14 9 0 3 2 0.65 1.37 79 C 2 -3 -4 -5 8 -4 -5 0 -5 -2 -1 -4 -2 1 -5 -1 -1 -4 -2 2 21 1 0 0 33 0 0 8 0 2 6 0 1 7 0 3 4 0 1 12 0.92 1.36 80 N -2 -4 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