Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 A 4 -2 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -3 -1 -2 -3 -2 3 0 -3 -2 -1 59 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41 0 0 0 0 0.57 0.23 2 C 3 -4 -3 -4 8 -3 -3 1 -3 -2 -3 -3 -2 -3 -3 -1 -2 -3 -3 -2 33 0 0 0 54 0 0 13 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.06 0.32 3 G -1 -4 -2 -3 -4 -4 -4 7 -4 -6 -5 -3 -4 -5 -4 -2 -3 -4 -5 -5 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.85 0.67 4 L -1 0 -4 -5 -3 -1 -4 -5 -4 1 4 -3 3 0 -2 -2 -1 -4 -3 2 3 6 0 0 0 3 0 0 0 6 47 0 8 3 2 4 3 0 0 14 0.53 0.81 5 V 0 -4 -4 -4 -3 -1 1 -5 -4 3 1 -3 2 0 -4 -3 0 -4 0 4 8 0 0 0 0 3 9 0 0 15 10 0 5 3 0 0 6 0 3 39 0.50 0.85 6 A 3 -4 -4 0 -1 -3 -3 -4 -4 1 -2 -1 0 -4 4 -2 -2 -5 -4 3 25 0 0 5 1 0 0 0 0 8 2 3 3 0 24 0 0 0 0 27 0.63 0.92 7 S -1 -1 1 -2 -3 1 1 -3 -3 -1 1 2 1 -1 -3 1 1 -3 1 -2 3 2 6 0 0 6 11 1 0 3 18 15 4 2 0 12 11 0 5 1 0.23 0.86 8 N -3 -1 6 0 -4 4 -2 0 4 -5 -4 -2 -3 -4 -2 0 -2 -4 -3 -4 1 1 44 3 0 25 0 7 9 0 1 0 0 0 2 5 0 0 0 0 0.95 0.94 9 L 0 -4 -2 -4 -4 -4 -1 5 -4 -2 1 -4 2 1 -4 -2 -3 -4 -2 -2 6 0 2 0 0 0 4 54 0 2 15 0 6 5 0 1 1 0 1 2 0.83 1.19 10 N -2 -3 1 0 -5 -3 0 5 0 -4 -6 -2 -5 -5 2 2 -3 -5 -5 -5 1 1 7 4 0 0 6 52 2 1 0 1 0 0 10 13 0 0 0 0 0.94 1.30 11 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 0 5 -5 5 3 -5 -3 -4 -4 -3 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 63 0 15 10 0 2 0 0 0 7 1.17 1.35 12 K -1 3 -1 -2 0 2 1 -3 1 -1 -4 3 -1 -2 -3 1 0 -5 0 -2 5 19 2 1 2 10 7 2 3 4 1 17 2 2 1 9 7 0 4 2 0.34 1.39 13 P 1 -4 -3 -1 -4 -1 -1 -4 -3 -1 -2 -2 -3 -1 6 -1 0 -5 -2 2 11 1 1 4 0 2 4 0 1 3 4 1 0 3 40 4 5 0 1 15 0.78 1.36 14 G -2 -1 -3 -2 -5 -4 -4 7 -1 -6 -6 -2 -5 -6 -5 -2 -3 -5 -5 -6 1 4 0 2 0 0 0 86 1 0 0 3 0 0 0 2 1 0 0 0 1.79 1.40 15 E -2 1 -3 0 0 2 -1 -4 3 -4 -1 4 3 -3 -4 2 0 1 -4 -3 2 8 0 6 2 11 4 0 7 0 6 23 9 1 0 14 5 2 0 1 0.46 1.42 16 C -2 1 -1 -4 4 0 0 -5 1 0 -1 1 3 -3 -4 2 2 -1 -4 0 3 9 3 0 9 3 6 0 3 4 6 10 7 1 0 15 13 1 0 7 0.31 1.42 17 L -3 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 5 3 -5 2 0 -6 -3 -3 -5 -4 4 2 0 0 0 0 0 0 0 0 33 30 0 5 4 0 1 0 0 0 25 1.02 1.42 18 R -2 2 -2 -2 -5 -2 1 -5 -2 1 0 1 -1 0 -5 -3 4 -5 1 1 3 12 1 2 0 1 9 0 1 10 8 7 1 4 0 0 28 0 4 9 0.39 1.42 19 V -3 -6 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 6 1 -5 -1 0 -6 -3 -3 -5 -4 4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 48 13 0 1 4 0 1 0 0 0 31 1.20 1.42 20 R -3 2 0 -4 -2 2 -2 -3 2 0 -2 2 2 -2 -5 1 1 -5 2 1 1 11 4 0 1 10 1 2 6 5 2 15 7 1 0 10 9 0 6 9 0.32 1.42 21 G 0 -5 -3 -4 -2 -4 -5 7 -5 -6 -5 -4 -5 -6 -5 -3 -4 -5 -6 -4 7 0 0 0 1 0 0 89 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1.92 1.42 22 E -3 2 -4 -3 -1 -1 -1 -5 3 3 -1 1 2 0 -5 -2 2 -5 -1 2 1 12 0 1 2 3 5 0 6 15 4 11 5 4 0 2 15 0 2 13 0.34 1.43 23 V -1 -3 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 3 0 -4 0 -1 3 -2 0 -4 -2 5 5 1 0 0 0 0 0 1 0 16 7 0 1 2 18 2 6 0 1 38 0.72 1.33 24 A -1 -1 2 1 0 -2 -1 -2 2 0 0 2 -3 -2 2 0 0 1 -1 -3 6 4 11 9 2 2 3 2 5 5 11 12 0 1 10 5 6 2 3 1 0.18 1.35 25 A 0 -3 0 2 -3 -1 0 -1 2 -3 -1 1 -2 -5 5 1 -2 -5 -3 -4 9 1 5 10 1 2 4 5 4 1 7 9 1 0 26 11 1 0 1 1 0.47 1.42 26 D -2 -2 4 4 -5 -1 0 2 4 -5 -2 -1 -4 -4 -1 -1 0 -5 -4 -5 2 1 20 25 0 2 4 16 9 0 5 4 0 1 2 4 5 0 0 0 0.63 1.39 27 A 4 -2 -2 -2 3 -1 0 0 -2 -2 -4 -3 0 -5 4 0 -1 -1 -4 -2 38 2 2 1 6 3 6 6 1 2 1 1 2 0 18 7 2 1 0 2 0.58 1.37 28 K -2 0 1 3 -5 1 1 1 2 -3 -4 3 -4 -5 -1 0 0 -5 -4 -3 3 4 7 16 0 7 10 10 5 1 1 21 0 0 2 5 6 0 0 1 0.42 1.35 29 S -2 6 0 -2 -5 2 -1 -1 0 -4 -4 1 -1 -3 -4 2 -3 -5 -3 -2 2 41 4 2 0 8 2 5 2 1 0 5 2 1 0 19 0 0 1 3 0.74 1.35 30 F -3 -5 -5 -6 0 -5 -5 -5 -4 0 0 -5 -1 8 -6 -2 -4 4 0 -1 2 0 0 0 2 0 0 0 0 6 6 0 1 71 0 3 0 6 0 3 1.68 1.37 31 L 2 -1 1 -1 -3 2 0 -3 3 -2 -4 -2 -4 -1 -4 2 1 -5 1 1 15 3 6 4 0 11 4 2 8 2 1 1 0 3 0 18 8 0 4 10 0.30 1.39 32 L -3 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -6 6 1 -5 -1 0 -5 -5 -2 -5 -4 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43 10 0 1 3 0 0 2 0 0 39 1.21 1.39 33 N -3 -2 7 4 -5 -1 0 -2 -1 -3 -6 -2 -5 -5 -4 -1 -2 -6 -3 -5 1 1 54 22 0 2 6 2 1 2 0 1 0 0 0 4 2 0 1 0 1.25 1.39 34 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -5 0 5 -5 0 6 -6 -4 -4 -3 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 55 0 1 32 0 1 0 0 1 5 1.27 1.42 35 G -1 -2 0 -1 2 4 -3 3 1 -3 1 -2 -2 -2 -3 -1 0 -4 1 -1 4 2 4 3 5 18 1 22 4 1 13 1 0 1 1 4 6 0 4 4 0.31 1.40 36 K -2 1 0 -1 6 1 1 -1 3 -4 -2 3 -2 -2 -3 0 1 -5 0 -4 2 6 4 3 15 6 8 6 7 0 3 17 1 2 1 6 10 0 3 1 0.41 1.38 37 D -2 0 0 3 -1 -1 1 3 1 -6 -6 -1 -5 -4 2 2 -2 -6 -5 -5 2 5 3 20 1 2 10 24 3 0 0 3 0 1 10 15 2 0 0 0 0.56 1.42 38 D -2 2 2 1 0 0 -1 2 0 -4 -4 0 1 -5 0 2 0 -1 -4 -3 2 12 9 8 2 4 4 17 2 1 1 5 4 0 5 15 6 1 0 2 0.29 1.37 39 N 0 0 2 3 -1 -1 1 1 -2 -5 -5 -1 -4 -5 3 2 0 -5 -5 -5 7 4 9 15 2 3 10 12 1 0 0 3 0 0 13 14 5 0 0 0 0.43 1.35 40 N -2 -3 3 6 -5 -3 -1 -2 1 -2 -5 -1 -4 -5 -1 -2 -1 2 -3 -2 3 1 16 51 0 0 3 2 3 3 0 3 0 0 4 2 3 3 1 3 0.96 1.31 41 L -2 -2 -5 -4 -4 -5 -5 -6 -3 6 1 -3 -2 -2 -2 -4 -2 0 -2 4 2 2 0 1 0 0 0 0 1 46 10 1 0 1 2 1 1 1 1 28 0.95 1.34 42 C 5 -4 -3 -4 2 -4 -4 0 -4 1 -1 -4 -1 -2 1 -1 -2 -5 -4 1 51 0 1 0 4 0 0 6 0 8 5 0 1 1 8 2 2 0 0 10 0.67 1.29 43 L -3 -5 -6 -6 0 -5 -5 -6 -5 1 4 -5 1 5 -6 -5 -4 1 1 0 2 0 0 0 2 0 0 0 0 5 48 0 3 30 0 0 0 2 3 4 1.06 1.33 44 H -4 0 -2 -2 -5 1 0 -4 10 -5 -3 -1 -1 -4 -4 -3 -4 -5 -1 -5 0 3 0 1 0 6 4 0 77 0 2 3 1 0 0 0 0 0 0 0 2.12 1.31 45 F -4 -5 -5 -5 0 -5 -5 -5 -4 2 2 -5 1 7 -5 -4 -4 -3 1 1 0 0 0 0 2 0 0 0 0 14 19 0 3 46 0 1 0 0 3 8 1.09 1.28 46 N -2 1 7 0 1 -1 -1 -1 -1 -5 -5 1 -4 -5 -4 1 -1 -5 -4 -4 3 7 51 3 3 1 2 4 1 0 1 8 0 0 0 12 2 0 0 0 0.96 1.27 47 P 0 -4 -4 -4 -2 -1 -4 -4 -1 1 -1 -4 -3 0 6 -2 -1 -5 -4 2 8 0 0 0 1 2 0 0 2 7 6 0 0 4 46 1 3 0 0 19 1.03 1.27 48 R -4 7 1 -1 -1 -1 -1 -4 1 -3 -4 -1 -4 -4 -4 -1 -3 -5 0 -2 0 68 5 3 1 2 4 1 3 1 0 0 0 0 0 3 0 0 3 3 1.27 1.29 49 F -4 -2 -4 -5 -4 -4 -4 -5 -3 -1 1 -3 0 8 -3 -4 -4 2 2 -3 1 2 0 0 0 0 1 1 0 2 13 1 2 66 1 1 1 2 5 1 1.45 1.24 50 N 0 0 2 3 -3 -1 1 1 1 -3 -3 0 -1 -3 0 1 1 -3 -3 -3 6 4 11 16 0 1 9 12 3 2 3 6 2 1 4 12 7 0 1 1 0.26 1.08 51 A 1 -1 0 2 1 -1 3 -1 3 -2 -2 0 -2 -1 -2 1 -2 -1 1 -2 11 3 3 12 3 2 17 4 7 2 3 5 1 3 2 10 2 1 6 2 0.22 1.00 52 H 0 0 -1 0 -2 1 0 0 4 -2 -1 0 -2 -1 -1 0 -1 4 1 -1 7 4 2 6 1 8 5 7 12 2 6 5 1 3 4 8 3 6 4 5 0.20 0.80 53 G 0 -2 0 -1 -2 -1 -1 2 -2 -2 -2 -2 -2 0 3 1 0 1 0 -1 8 2 5 4 1 3 4 17 1 3 4 2 1 4 14 11 6 2 3 4 0.19 0.78 54 D -1 1 0 4 0 -1 1 1 -1 -2 -2 -1 -2 -2 -2 -1 1 1 -2 -1 4 8 4 27 2 2 7 10 2 2 4 4 1 2 2 5 8 2 1 4 0.29 0.80 55 V -1 1 0 1 -2 2 2 0 -2 0 -1 2 -2 -2 -2 -1 0 0 -2 -1 5 7 4 7 1 10 13 7 1 5 7 13 1 1 2 3 6 1 1 5 0.15 0.88 56 N -1 2 4 0 -2 -1 -2 2 1 -4 -2 1 -3 -4 2 1 -2 -4 -3 -4 3 11 18 6 1 2 1 17 4 1 3 9 0 1 10 11 1 0 0 1 0.40 1.16 57 T 0 0 -3 -4 2 2 -1 -4 2 0 -1 1 0 -2 -2 -1 2 -4 2 2 7 5 0 0 4 9 5 1 6 4 6 8 2 1 2 4 12 0 7 19 0.24 1.26 58 I -3 -3 -5 -6 -1 -5 -5 -6 -5 6 1 -5 0 0 -5 -4 -2 -5 -3 5 0 1 0 0 1 0 0 0 0 43 8 0 1 4 0 0 2 0 0 37 1.12 1.33 59 V -1 -5 -5 -5 -1 -3 -2 -6 -5 3 1 -5 -2 -1 -5 -4 -1 -5 -4 6 5 0 0 0 1 1 3 0 0 14 9 0 0 2 0 0 3 0 0 61 1.04 1.35 60 C -3 5 -3 -5 6 0 -4 -4 0 -2 0 -2 4 2 -5 -4 -2 -4 0 -3 1 35 1 0 19 4 0 1 2 1 8 0 12 8 0 0 2 0 3 1 0.91 1.48 61 N -3 -2 8 -2 -5 -1 -3 -3 -2 -6 -6 -3 -5 -6 -5 -1 0 -6 -5 -5 1 1 86 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 4 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