Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 E -2 -1 -1 1 -5 4 6 -3 -1 -4 -4 0 -3 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -4 0 0 0 3 0 28 68 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.02 0.37 2 Q -2 1 1 -1 -5 7 3 -3 -1 -4 -4 0 -2 -5 -3 -1 -2 -4 -3 -4 0 7 5 0 0 68 20 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.10 0.52 3 C -2 -5 -4 -5 11 -5 -5 -4 -5 -3 -3 -5 -3 -4 -4 -2 -2 -4 -4 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.53 0.58 4 G -1 -2 -2 -3 -4 -3 -4 7 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -4 -2 -3 -4 -5 -5 0 3 0 0 0 0 0 97 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.68 0.58 5 R -1 5 -1 -2 -4 1 -1 -2 -2 -4 -4 1 -3 -1 1 3 0 -4 -3 -4 1 37 1 0 0 6 2 1 0 0 0 8 0 4 6 31 3 0 0 0 0.62 0.62 6 Q -1 -1 0 0 -4 7 0 -3 -1 -4 -2 -1 -2 -1 -3 -1 -2 -3 0 -3 3 0 2 5 0 72 2 0 0 0 5 0 0 3 0 3 0 0 3 0 0.98 0.60 7 A 6 0 -1 -3 -2 -2 -2 0 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -3 0 -2 -4 0 -2 81 4 3 0 0 0 0 5 0 0 1 1 0 0 0 2 0 0 3 0 0.86 0.62 8 G -1 -1 0 -1 -4 -3 -2 6 -3 -5 -5 0 -4 -5 0 -1 -3 -4 -4 -5 2 3 4 2 0 0 2 73 0 0 0 7 0 0 4 3 0 0 0 0 1.11 0.62 9 G -1 -2 1 -1 -4 -1 -3 6 -3 -5 -5 -3 -4 -5 -4 -2 -3 -4 -5 -5 0 2 6 2 0 3 0 87 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.45 0.62 10 K 5 0 -2 -1 -2 1 -2 0 -3 -3 -3 0 -2 -4 -2 0 0 -4 -3 -1 69 4 0 3 0 6 0 4 0 0 0 6 0 0 0 3 5 0 0 1 0.66 0.57 11 L -2 1 -3 -2 -3 -2 -1 -3 -3 -1 3 -1 -1 -1 0 -2 2 -4 -3 1 2 10 0 3 0 0 5 1 0 0 42 2 0 1 5 0 17 0 0 13 0.34 0.57 12 C -2 -5 -4 -5 11 -4 -5 -4 -5 -3 -3 -5 -3 -4 -4 -2 -2 -4 -4 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.50 0.57 13 P 1 -3 -3 -3 -4 -1 -2 -2 0 -4 -3 -2 -3 -5 7 0 -2 -5 -4 -3 10 0 0 0 0 2 0 1 3 0 2 0 0 0 74 8 0 0 0 0 1.69 0.57 14 N 0 -2 5 0 -4 -2 -2 4 -2 -3 -1 -1 -3 -4 -2 0 -2 -4 -4 -2 5 1 36 4 0 0 0 30 0 0 9 3 0 0 1 5 0 0 0 3 0.58 0.57 15 N -2 0 4 -1 3 -2 -3 5 -3 -4 -3 -2 -4 -4 -4 -1 -2 -4 -4 -4 0 5 24 2 8 0 0 55 0 0 3 2 0 0 0 1 0 0 0 0 0.89 0.57 16 L -1 -2 -1 -2 -3 0 -3 -4 -4 0 5 -3 1 -1 -4 -3 -2 2 -2 1 6 2 3 2 0 6 0 0 0 1 68 0 1 0 0 0 0 3 0 8 0.62 0.57 17 C -2 -5 -4 -5 11 -4 -5 -4 -5 -3 -3 -5 -3 -4 -4 -2 -2 -4 -4 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.50 0.57 18 C -2 -2 -4 -5 11 -4 -5 -4 -4 -3 -3 -4 -3 -4 -4 -2 -2 -4 -4 -2 0 3 0 0 97 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.38 0.57 19 S 0 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -1 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 6 0 -4 -3 -3 0 0 0 0 0 0 0 3 0 2 0 0 0 0 0 95 0 0 0 0 1.08 0.57 20 Q -2 1 0 -1 -4 6 2 -3 -1 -2 -4 3 -2 -2 -3 0 -1 -4 -3 -3 0 4 4 0 0 44 14 0 0 3 0 24 0 2 0 4 2 0 0 0 0.74 0.57 21 W -3 -4 -4 -5 -4 -4 -4 -3 0 -2 -2 -4 -2 6 -5 -2 -3 7 5 -2 1 0 0 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 47 0 2 0 17 26 2 1.29 0.57 22 G -1 -4 -2 -3 -4 -3 -4 7 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -4 -2 -3 -4 -5 -5 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.75 0.57 23 W -4 -4 -1 -5 -4 -3 -4 -4 -2 -3 -3 -4 -3 4 -5 -4 -4 11 5 -4 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17 0 0 0 61 18 0 2.18 0.57 24 C -2 -5 -4 -5 11 -4 -5 -4 -5 -3 -3 -5 -3 -4 -4 -2 -2 -4 -4 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.50 0.57 25 G 0 -4 -2 -3 -4 -3 -4 7 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -4 -2 -3 -4 -5 -5 3 0 0 0 0 0 0 97 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.68 0.57 26 S -1 -1 4 2 -3 -2 -2 -2 -2 -3 -1 -2 1 -4 -3 4 2 -4 -3 -2 0 2 25 11 0 0 0 0 0 0 6 0 5 0 0 36 13 0 0 3 0.52 0.57 27 T -1 -3 0 -1 -2 -2 -2 -2 -3 -2 -3 -2 -2 -4 -3 1 6 -4 -3 -2 0 0 3 3 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 4 87 0 0 0 1.08 0.56 28 D 0 -2 2 3 -4 0 2 -1 -2 -3 -4 -1 -3 -4 1 2 -1 -4 -1 -2 6 1 10 21 0 4 16 3 0 1 0 3 0 0 8 21 1 0 2 3 0.40 0.56 29 E 0 -3 -1 5 -4 0 3 -3 -2 -4 -3 -2 -4 -5 3 -1 -2 -5 -4 -4 8 0 0 44 0 3 25 0 0 0 2 0 0 0 16 1 1 0 0 0 0.87 0.57 30 Y -3 -3 -4 -5 -4 -3 -4 -5 1 -3 -2 -3 -2 4 -5 -3 -3 2 8 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 14 0 0 0 2 82 0 1.66 0.57 31 C -2 -5 -4 -5 11 -4 -5 -4 -5 -3 -3 -5 -3 -4 -4 -2 -2 -4 -4 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.46 0.54 32 S 2 -1 2 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -3 -3 -1 -2 -3 -2 4 1 -4 -2 -2 19 0 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60 6 0 0 0 0.49 0.18 33 X -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.34 0.00 K Lambda Standard Ungapped 0.1378 0.3204 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1843 0.3176 PSI Gapped 0.0564 0.2670