Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 G 0 -3 -1 -2 -3 -2 -3 6 -3 -4 -4 -2 -3 -4 -3 -1 -2 -3 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.31 0.18 2 P 3 -3 -3 -3 -3 -2 -2 -2 -3 -3 -4 -2 -3 -4 6 0 1 -5 -4 -3 38 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48 4 10 0 0 0 1.17 0.55 3 N 0 1 3 2 -4 0 2 1 -3 -1 -4 -2 -4 -5 1 2 -2 -5 -4 -4 6 7 14 13 0 3 15 9 0 5 0 0 0 0 7 21 0 0 0 0 0.40 0.80 4 S 2 0 -3 1 -4 -2 2 -2 -3 -4 -5 -2 -4 -5 5 1 -1 -5 0 -4 21 7 0 9 0 0 14 2 0 0 0 0 0 0 33 9 2 0 3 0 0.76 0.89 5 G -2 0 0 -1 -5 -3 1 5 -4 -5 -5 -3 -2 -5 3 1 0 -5 -5 -2 1 6 5 3 0 0 10 42 0 0 0 0 1 0 15 10 5 0 0 4 0.69 0.99 6 T -2 4 1 -1 -4 1 -2 -1 1 0 -4 2 0 -4 -4 3 0 -5 -4 -1 0 27 6 2 0 6 0 5 3 6 0 11 3 0 0 22 4 0 0 4 0.45 0.95 7 L 1 -2 -2 0 -4 -2 1 -4 5 -2 3 -1 3 -3 -3 -2 -2 -4 -2 -1 14 1 1 6 0 0 11 0 16 1 30 3 8 0 1 1 2 0 1 4 0.43 0.97 8 A 4 -1 -1 -1 -3 0 0 0 -3 -4 -4 1 -3 -5 0 2 0 -5 -4 0 38 2 1 3 0 4 4 7 0 0 0 8 0 0 4 16 5 0 0 6 0.44 0.97 9 L -1 -4 -3 1 -2 -3 -2 -2 1 0 3 -1 2 1 -3 1 0 -4 -3 1 4 0 0 9 1 0 1 3 4 5 29 4 6 5 1 12 4 0 0 12 0.26 0.97 10 L 1 -2 -3 -4 -4 0 -3 -2 4 2 1 0 1 -3 1 -1 1 -5 -3 0 16 2 0 0 0 4 0 3 11 14 15 5 4 1 8 3 9 0 0 4 0.27 0.95 11 L 0 0 1 -1 -4 -1 -1 -4 -4 -1 2 -2 2 -1 4 -1 0 1 -3 -2 10 5 7 3 0 3 4 0 0 2 25 2 6 3 19 2 6 2 0 2 0.32 0.98 12 D -2 0 4 4 -5 -2 3 1 -1 -5 -3 -1 -4 -5 -2 1 -1 -5 -4 -5 2 4 18 24 0 0 19 11 1 0 3 3 0 0 1 10 2 0 0 0 0.59 1.01 13 E 1 -2 -2 -1 -5 -2 3 1 -1 -4 -2 3 -4 0 2 -1 -1 -4 -1 -3 10 0 1 3 0 0 22 11 2 0 4 18 0 5 12 3 4 0 2 2 0.37 1.05 14 G 0 -3 1 0 3 -1 -2 3 0 -4 -2 -2 -2 0 -4 1 3 -4 0 -2 8 0 7 6 7 2 2 19 2 0 4 2 1 4 0 12 19 0 3 2 0.32 1.04 15 S 0 0 1 -2 5 -1 0 -3 -3 -1 -3 0 -3 -2 2 3 1 -5 -4 -1 8 4 6 2 13 2 6 0 0 3 2 6 0 2 10 24 8 0 0 4 0.38 1.04 16 K 0 4 -2 3 -5 1 -1 -1 -3 -4 -4 3 0 -5 1 -1 -2 -5 -4 -1 8 23 1 15 0 7 2 4 0 0 0 20 3 0 7 3 2 0 0 4 0.50 1.08 17 Q -2 6 -3 -1 1 1 -1 -3 1 -2 -4 1 -4 -3 1 1 -1 -5 -3 -3 2 48 0 3 4 6 3 1 3 3 1 5 0 1 8 9 2 0 1 1 0.77 1.16 18 L -1 -1 -5 -3 -4 -3 -4 -3 -3 -2 4 -3 1 0 4 -2 -3 3 -3 -1 6 3 0 1 0 1 0 2 1 0 43 1 3 4 23 3 1 4 0 4 0.68 1.19 19 P -2 -4 -2 3 -5 -3 -3 -3 -4 -4 -4 -3 -5 -6 8 -1 -2 -6 -5 -2 2 0 1 15 0 1 0 2 0 1 1 0 0 0 69 4 1 0 0 4 1.77 1.24 20 Q -2 -2 2 6 -5 0 -1 -3 1 -3 -4 1 -3 -3 -3 -2 -2 -5 0 -4 2 1 10 54 0 5 0 1 3 2 1 9 0 1 1 2 2 0 4 1 0.99 1.35 21 A -1 -5 -5 -1 -2 -5 -5 -6 -5 2 2 -5 -1 5 -6 -4 -2 -4 0 3 5 0 0 5 1 0 0 0 0 10 20 0 0 30 0 1 3 0 2 25 0.80 1.41 22 I -2 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -3 3 3 -5 1 4 -6 -5 -4 4 3 1 3 0 0 0 0 0 0 0 1 17 31 0 4 20 0 0 0 5 10 8 0.87 1.40 23 I -3 -5 -4 -6 0 -5 -6 -2 -6 6 2 -5 0 -2 -5 -3 -3 -5 -3 3 1 0 1 0 2 0 0 4 0 47 19 0 2 1 0 2 1 0 0 21 1.01 1.41 24 I 1 -5 -5 -6 3 -5 -5 -3 -6 5 1 -5 1 -4 0 -2 -2 -5 -4 4 13 0 0 0 5 0 0 2 0 32 9 0 3 0 6 2 1 0 0 27 0.77 1.42 25 G 0 -5 -2 -4 -4 -4 -4 5 -5 -5 -5 -4 -5 -5 -4 2 3 1 -5 -3 7 0 1 0 0 0 0 53 0 0 0 0 0 0 0 13 23 2 0 1 1.13 1.42 26 V 2 -2 -3 -5 -2 -2 -4 -4 0 -2 -1 -4 3 2 0 0 0 -1 5 1 15 2 1 0 1 2 1 1 2 1 5 0 9 8 6 6 7 0 23 11 0.49 1.38 27 K -2 0 -3 -3 -5 2 -1 -3 0 -5 -5 0 2 -3 7 -3 -2 -5 -3 -3 3 6 1 1 0 12 2 2 2 0 0 5 5 1 57 1 2 0 1 1 1.37 1.45 28 K -2 3 -3 -2 -5 -2 -2 -4 0 -5 -4 7 -4 -5 -4 -3 -3 -5 -4 -3 2 14 0 2 0 0 1 0 2 0 2 74 0 0 0 0 0 0 0 2 1.46 1.45 29 G 2 -4 -2 -4 6 -3 -4 1 -4 -4 -5 -4 -4 -5 -4 5 1 -5 -5 -4 17 0 1 0 19 0 0 10 0 0 0 0 0 0 0 43 9 0 0 0 1.01 1.45 30 G 0 -5 -3 -4 -5 -5 -5 7 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -5 -2 -4 -5 -6 -6 6 0 0 0 0 0 0 91 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 2.05 1.54 31 T -2 -3 -2 -4 -4 -4 -4 -3 -4 -2 -4 -3 -4 -3 -4 1 7 -5 -4 -3 2 1 1 0 0 0 0 1 0 2 1 1 0 1 0 8 83 0 0 0 1.62 1.55 32 R -3 1 1 -4 -4 -3 -3 -3 1 -2 -4 -3 -4 -5 -4 1 6 -6 -5 -2 0 7 6 0 0 0 1 2 4 2 1 1 0 0 0 10 64 0 0 2 1.19 1.70 33 A 1 -4 -5 -1 -5 -5 -5 -5 -5 -3 0 -5 -1 -1 -6 -1 -1 11 -1 -3 12 1 0 4 0 0 0 0 0 1 10 0 2 1 0 5 3 58 1 2 2.13 1.70 34 L -3 -5 -5 -6 0 -5 -5 -6 -5 2 5 -5 3 -1 -5 -2 1 -5 -4 1 2 0 0 0 2 0 0 0 0 10 54 0 8 2 0 3 8 0 0 10 0.95 1.76 35 L -1 -1 -2 -3 -1 4 1 -3 4 -1 1 -1 -2 1 -5 0 -3 2 3 -2 5 4 1 1 1 19 8 2 10 3 15 4 1 5 0 8 1 3 9 2 0.38 1.73 36 E 1 0 1 1 -5 2 4 -4 1 -5 -3 -1 -2 -2 -3 -1 0 -2 0 -2 11 5 7 6 0 9 31 1 4 0 3 3 1 2 1 4 6 1 4 3 0.45 1.73 37 F -2 -3 -2 -3 -2 0 -3 -6 -1 4 2 -1 5 4 -5 -3 -2 0 1 -1 2 1 2 2 1 4 2 0 1 22 15 4 15 16 0 1 2 1 5 3 0.60 1.77 38 L -1 -2 -5 -6 -4 -5 -3 -3 -5 3 5 -5 0 -1 -5 -5 -2 -5 -4 1 6 2 0 0 0 0 2 2 0 17 57 0 2 1 0 0 2 0 0 7 0.95 1.75 39 R 0 1 2 1 2 0 -1 0 0 0 -2 -1 -4 -3 -3 2 1 1 1 -1 8 8 10 7 4 4 3 8 2 5 3 4 0 1 1 13 8 2 4 3 0.15 1.71 40 V 0 1 -1 0 0 3 -1 -3 -1 -2 2 -1 4 -3 -5 -1 -2 -5 -1 0 9 9 3 5 2 12 4 2 1 1 21 3 11 1 0 4 3 0 2 6 0.28 1.75 41 H -2 -1 2 1 -5 0 -1 -2 8 -2 -3 -2 1 -2 -4 -2 -2 -5 -3 -2 4 3 11 9 0 3 3 3 42 3 2 2 3 2 0 3 2 0 0 4 1.04 1.73 42 P -1 1 -1 -1 1 -3 -1 1 -1 -4 -2 0 -4 -5 5 0 0 -5 -1 -1 4 8 2 4 3 0 4 10 2 0 4 5 0 0 33 6 6 0 2 4 0.57 1.70 43 D -1 -1 1 4 -5 2 2 0 0 -4 -1 -1 0 -2 -2 0 -2 0 -1 -2 6 4 7 21 0 9 12 7 2 0 6 3 2 2 2 8 2 1 2 3 0.26 1.73 44 V 0 -2 -4 1 -1 -4 -2 -3 -1 4 1 -1 -3 -1 -2 -2 0 0 -4 3 8 3 0 8 2 0 3 2 2 21 11 4 0 2 3 2 7 2 0 18 0.29 1.76 45 R 0 1 -2 -1 1 0 1 -3 2 -1 -1 -1 2 2 -1 -1 0 3 3 -1 8 8 1 3 3 3 8 2 6 3 5 3 5 9 3 5 7 3 9 4 0.19 2.03 46 A 2 -2 -1 -1 -1 0 -2 -1 -1 -3 -2 2 1 0 1 3 -1 -1 0 -2 14 2 3 4 1 5 2 4 2 1 4 13 3 4 8 19 4 1 3 3 0.22 1.99 47 V 2 -1 2 -2 5 -2 -3 -2 -3 0 -1 -2 -4 -3 2 1 1 -6 -5 1 14 4 9 2 13 2 1 4 1 6 7 2 0 1 10 9 7 0 0 10 0.34 2.02 48 G -1 0 -1 0 -2 2 0 3 0 -1 -1 0 0 1 0 0 -1 -5 -2 -1 4 5 2 6 1 8 6 21 2 3 6 7 2 6 4 8 3 0 2 5 0.17 1.97 49 A -1 2 -1 -1 -1 -1 2 -1 0 -3 -3 4 -1 -3 1 -1 -1 -5 -3 -3 5 12 2 4 1 2 12 5 2 1 2 26 1 1 8 5 4 0 1 2 0.40 1.95 50 E 0 -1 -1 1 -5 0 6 -2 -1 -2 -2 0 -2 -2 -3 -1 -2 -1 -2 -2 6 3 3 8 0 3 47 3 2 2 3 5 1 2 1 4 2 1 1 3 0.71 1.93 51 P 0 -4 -2 -2 -4 -2 -2 -2 -2 1 0 -1 -1 -2 5 -2 1 -1 -1 1 7 0 2 2 0 2 3 4 1 10 11 4 1 1 30 2 8 1 2 8 0.49 1.93 52 H -2 0 1 -1 2 1 -1 -1 7 1 -3 1 -1 -2 -1 0 -1 -1 0 -3 3 4 8 4 4 5 3 4 24 8 3 8 1 1 4 6 3 1 3 2 0.46 1.88 53 F -3 -2 -4 -3 0 -2 -3 -3 -1 0 0 -2 -1 6 -1 -2 -1 6 4 -1 2 3 1 2 2 2 2 2 1 5 8 3 1 30 3 3 3 11 12 5 0.73 1.87 54 F -2 -2 -2 -3 -1 -2 -1 -3 0 1 1 -3 0 6 -5 -3 -1 6 1 -2 3 2 2 2 1 2 5 2 3 7 12 2 2 34 1 2 4 10 3 3 0.74 1.88 55 D -2 2 2 4 0 -1 1 -1 -1 0 -2 -2 -2 -5 1 -1 -1 -5 -2 -3 2 11 9 23 2 3 10 5 1 5 5 2 1 0 8 5 4 0 1 2 0.36 1.99 56 R -1 4 0 0 -5 0 1 -1 2 -1 -1 0 0 -1 -1 -1 -1 1 0 -1 5 22 4 5 0 5 10 4 5 4 6 5 3 2 3 5 3 2 3 4 0.23 1.99 57 S -2 1 2 -1 2 0 1 -2 3 0 -1 1 -4 -1 1 0 -1 2 0 -1 3 8 9 4 4 4 8 4 7 5 6 8 0 3 7 6 3 3 4 6 0.13 2.05 58 Y -2 1 0 -2 1 -1 -1 0 2 -1 -1 -1 1 1 1 -2 -1 4 4 -1 3 7 4 3 3 3 4 6 5 4 7 4 3 6 8 3 4 5 13 4 0.20 2.07 59 D -1 1 -1 1 0 0 1 -2 2 0 -1 -1 -2 1 1 -1 -1 3 1 0 6 8 3 8 2 4 10 3 6 5 6 4 1 6 6 4 4 4 4 6 0.11 2.07 60 K -1 2 0 -1 -1 1 2 -2 1 -2 -1 3 2 -2 0 -2 -1 2 -3 -2 5 11 4 3 1 6 13 3 3 3 7 16 4 2 6 2 3 2 1 3 0.23 2.09 61 G -1 0 -1 2 1 0 2 3 -1 -5 -3 -1 -2 0 1 0 -1 0 -2 -2 5 5 3 10 3 3 12 24 2 0 3 3 1 4 6 6 4 2 1 4 0.27 2.08 62 L -2 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