Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 V -2 -4 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -5 3 3 -4 0 -2 -4 -4 -2 -4 -3 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12 38 0 0 0 0 0 0 0 0 50 0.86 0.63 2 D -2 -2 2 4 -5 -1 5 -4 -2 -5 -5 0 -4 -5 -3 -2 0 -5 -4 -4 3 0 9 25 0 0 54 0 0 0 0 3 0 0 0 0 6 0 0 0 1.03 0.81 3 F -4 -5 -5 -6 -4 -5 -5 -5 -3 -2 -1 -5 -2 8 -6 -4 -4 1 4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 71 0 0 0 1 12 12 1.56 0.91 4 H -2 -3 2 -1 -4 0 -2 0 8 -5 -5 -1 -4 0 -4 2 0 -5 -2 -4 3 0 11 2 0 3 0 7 45 0 0 2 0 4 0 19 5 0 0 0 1.01 0.94 5 G -1 -4 -3 -4 -5 -4 -4 7 -4 -5 -5 -4 1 -5 -4 -2 -4 -5 -5 -5 3 0 0 0 0 0 0 92 0 0 0 0 5 0 0 0 0 0 0 0 1.81 0.94 6 Y -4 -4 -4 -5 -5 -4 -4 -5 0 -4 -3 -4 -3 1 -5 -4 -4 0 9 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 2.40 0.96 7 A 4 -4 -4 -5 -3 -3 -4 0 -3 -1 1 -4 4 4 -4 -1 -3 -3 2 -2 38 0 0 0 0 0 0 6 0 3 11 0 12 17 0 5 0 0 8 1 0.59 0.96 8 R -3 7 -2 -4 -5 -1 -2 -4 -2 -5 -4 1 -4 -5 -4 1 -3 -5 -4 -5 0 85 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 11 0 0 0 0 1.66 0.96 9 S 2 -3 -2 -2 -3 -3 -3 0 -3 -2 -2 -3 4 -3 -3 5 -2 2 2 -3 14 0 0 1 0 0 0 5 0 2 3 0 11 0 0 52 0 3 8 0 0.70 0.96 10 G -2 -4 2 -3 -5 -4 -4 7 -4 -6 -6 -4 -5 -5 -4 -2 -4 -5 -5 -5 0 0 11 0 0 0 0 89 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.79 0.96 11 I 2 -4 -1 -5 -3 -4 -4 -4 -4 3 1 -4 1 2 -1 -2 -1 5 -2 3 16 0 3 0 0 0 0 0 0 17 12 0 3 9 3 3 2 7 0 24 0.49 0.96 12 G 0 2 -3 -4 -4 -2 -4 4 2 1 1 -3 0 -4 -4 -1 -1 -5 -4 0 6 11 0 0 0 1 0 40 6 8 13 0 2 0 0 3 4 0 0 5 0.53 0.96 13 W -1 -4 -4 -4 -4 -3 -4 2 -3 1 0 -2 3 2 -4 0 1 6 2 1 4 0 0 0 0 0 0 16 0 9 6 2 10 8 0 6 10 10 9 10 0.43 0.94 14 T 0 -3 5 -2 -3 -2 -2 -1 -3 -3 -4 -2 -3 -4 -3 3 4 -5 -4 0 7 0 29 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 28 25 0 0 6 0.73 0.91 15 G 1 -3 1 4 -4 -1 0 2 -1 -4 -4 0 0 -4 1 0 1 -5 -4 -3 12 0 5 26 0 2 4 16 2 0 0 5 3 0 6 7 9 0 0 1 0.42 0.91 16 S -1 -1 2 2 -4 2 1 1 2 -5 -5 0 -4 -5 -2 3 1 -5 -4 -4 2 3 10 12 0 9 9 11 4 0 0 5 0 0 1 28 7 0 0 0 0.48 1.05 17 G -1 -3 -1 3 -5 -3 -1 5 2 -5 -3 0 -4 -5 -4 0 -1 -5 -4 -5 3 0 2 17 0 0 3 52 5 0 2 5 0 0 0 5 4 0 0 0 0.88 1.03 18 G -1 -3 1 1 -4 -3 -2 5 -2 -4 -1 -2 -4 -5 0 0 1 -5 -5 -4 2 1 7 10 0 0 2 47 1 0 7 1 0 0 5 7 9 0 0 0 0.69 1.03 19 E -1 -2 1 -1 -4 2 1 -2 3 -1 -2 -3 0 0 3 0 1 -4 0 0 4 1 7 2 0 10 11 3 9 4 2 0 2 5 15 6 9 0 3 6 0.28 1.04 20 Q -2 1 1 1 -5 5 -2 0 2 -4 -4 2 2 0 -1 -2 -3 -4 2 -4 2 6 6 8 0 30 0 6 6 0 0 12 6 5 2 2 0 0 9 0 0.53 1.05 21 Q 0 -1 -1 -3 -4 2 -1 1 -3 -2 -2 2 0 -4 -4 1 3 -5 -1 1 7 3 3 0 0 9 3 11 0 2 4 13 2 0 0 13 18 0 2 10 0.27 1.05 22 C 0 0 -3 -1 7 -1 0 0 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -4 1 2 0 4 -2 8 5 0 3 25 2 6 8 0 0 3 1 0 0 0 10 12 1 14 2 0.59 1.03 23 F 1 -4 -1 -1 -4 -4 -4 -4 -3 0 -1 -1 -3 5 3 -1 -3 3 2 0 15 0 2 4 0 0 0 0 0 6 5 5 0 25 15 4 0 5 8 5 0.51 1.05 24 Q 1 -2 1 -1 -4 3 0 3 -3 -1 -3 1 -3 0 -4 0 -1 -4 -1 -2 13 1 6 4 0 13 4 23 0 4 2 8 0 5 0 8 2 0 2 3 0.29 1.01 25 A 1 -3 -1 -2 -3 -3 -3 3 -3 -3 2 1 -2 -3 -1 0 -1 -4 1 0 11 0 3 2 0 0 0 26 0 0 20 12 0 0 3 7 4 0 5 6 0.30 0.96 26 T 1 -3 2 -1 -3 -2 -1 2 -3 -1 0 -2 -3 -4 3 1 1 -4 -2 -3 10 0 10 2 0 0 3 19 0 3 10 2 0 0 16 13 8 0 1 1 0.33 0.84 27 G -1 -3 -2 -3 -3 0 -3 5 -3 -2 -3 -1 1 -4 0 -1 3 -4 -1 -1 2 0 0 0 0 5 1 43 0 1 1 4 4 0 4 3 24 0 3 5 0.63 0.83 28 A 4 -3 0 0 -3 -2 -2 2 -3 -1 -2 0 0 -4 2 -1 -2 -4 -4 -3 38 0 5 4 0 0 1 19 0 4 3 7 3 0 12 2 1 0 0 1 0.48 0.83 29 Q 0 -2 0 -1 -4 1 0 4 -3 -4 -1 -2 -3 -4 2 0 -2 -4 -1 -3 5 2 4 3 0 8 7 36 0 0 9 0 0 0 12 8 0 0 2 1 0.46 0.84 30 S 2 -1 -2 -3 -3 0 -2 1 -1 -3 -1 -1 -2 -3 -3 3 2 -3 -1 -1 22 3 1 1 0 4 1 9 1 1 6 3 0 0 1 29 13 0 2 3 0.37 0.81 31 K -2 -2 0 -4 -4 -1 -3 1 4 1 1 3 -2 -3 -4 -3 0 -4 -1 2 2 0 5 0 0 2 0 11 10 9 14 22 0 0 0 0 5 0 2 18 0.34 0.91 32 Y -3 -4 -3 -4 -5 -4 -4 6 -3 -4 -4 -4 -4 4 -5 -3 -4 -2 5 -4 0 0 0 0 0 0 0 60 0 0 0 0 0 17 0 0 0 0 23 0 1.32 0.91 33 R -3 7 -2 -3 -5 -1 -2 -1 -2 -5 -4 2 -3 -5 -4 -3 -3 -4 -4 -4 0 81 0 0 0 0 0 6 0 0 0 9 0 0 0 0 0 0 0 0 1.51 0.87 34 L -3 0 -5 -5 -4 -4 -4 -5 -4 1 5 -4 0 3 -5 0 -3 -3 -2 -1 0 6 0 0 0 0 0 0 0 4 70 0 0 11 0 9 0 0 0 0 0.91 0.91 35 G -2 -4 -2 -3 -4 -3 -4 7 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -4 -2 1 -4 -5 -4 0 0 0 0 0 0 0 87 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 1.62 0.87 36 N -4 -3 8 -1 -5 -2 0 -3 -2 -1 -1 -2 -3 -5 -4 -2 -2 -6 -4 -2 0 0 82 0 0 0 5 0 0 5 6 0 0 0 0 0 0 0 0 3 1.45 0.91 37 E 1 -2 -2 -1 -5 3 7 -4 -2 -5 -5 -1 -4 -5 -3 -2 -3 -5 -4 -4 10 0 0 0 0 11 79 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.39 0.91 38 C 1 -4 0 2 7 -3 -3 1 0 -1 -2 -3 0 -4 0 0 -2 -4 -1 -2 12 0 4 13 29 0 0 13 3 3 3 0 3 0 4 5 1 0 3 2 0.65 1.01 39 E -3 1 1 6 -5 -2 3 -3 0 -4 -5 -2 -4 -5 -3 0 -1 -5 -4 -4 1 7 6 49 0 0 19 1 2 0 1 0 0 0 0 8 3 0 0 0 0.96 0.95 40 T -2 -3 2 -1 -3 1 -1 2 -1 -1 -1 -3 -3 0 -3 1 4 -4 -3 -3 1 0 12 2 0 6 3 15 2 4 5 0 0 4 0 8 35 0 0 1 0.45 0.95 41 Y -2 -3 -3 -1 -4 -3 -3 -1 1 -3 -3 -1 -3 0 -4 0 -3 6 8 -3 4 1 1 4 0 1 1 5 2 1 1 5 0 1 1 6 1 13 54 1 1.21 0.90 42 A 1 -4 -4 -5 -4 -4 -4 2 -4 2 0 -4 2 2 -4 0 0 1 0 3 13 0 0 0 0 0 0 17 0 11 7 0 6 10 0 6 4 2 3 20 0.38 1.06 43 E -3 0 -2 2 -6 0 7 -4 -2 -6 -5 -1 -4 -6 -3 0 -3 -5 -4 -5 0 5 0 7 0 0 83 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 1.52 1.06 44 L 0 -5 -5 -5 -4 -4 -5 -5 -5 1 3 -5 1 4 0 -4 -1 -3 -2 2 9 0 0 0 0 0 0 0 0 8 35 0 3 22 4 0 3 0 0 16 0.67 1.06 45 K 0 -1 1 1 -4 2 -1 1 -3 0 -3 1 -3 -2 -4 -1 3 -5 -4 0 9 2 8 7 0 12 3 11 0 7 1 9 0 2 0 4 19 0 0 7 0.25 1.06 46 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 2 5 -5 2 3 -1 -5 -4 4 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 60 0 4 11 4 0 0 6 0 4 0.98 1.06 47 G 0 1 2 0 -4 1 0 1 -3 -2 -4 2 0 0 -4 1 -1 -5 -4 -2 8 7 9 5 0 8 6 13 0 3 0 16 3 4 0 12 3 0 0 2 0.26 1.06 48 Q -1 0 -1 -3 -5 4 1 -4 5 -4 -2 4 -3 -4 -3 -2 -3 -4 0 -1 4 2 3 0 0 24 7 0 15 0 3 32 0 0 0 2 0 0 3 4 0.73 1.02 49 E -2 1 2 2 -5 0 3 -2 4 -4 -3 2 -4 -5 -3 0 0 -5 -3 -3 2 7 8 10 0 3 24 3 12 0 2 13 0 0 0 5 7 0 0 2 0.49 1.02 50 V -2 -2 -4 -4 -3 1 -3 -4 -4 1 2 -3 -1 3 -4 0 0 1 -2 3 1 3 0 0 0 8 0 0 0 6 24 0 0 14 0 8 5 2 0 26 0.46 0.96 51 W -1 -1 -3 -1 -4 1 1 -4 -2 -3 0 2 0 1 -4 -3 -2 5 5 -1 4 2 0 3 0 8 12 0 0 0 10 12 2 6 0 0 2 9 23 4 0.52 0.95 52 K 2 -2 3 1 -4 -1 -2 -2 1 -4 -1 1 -3 0 -1 1 1 -4 0 -3 17 2 18 8 0 3 1 2 4 0 8 9 0 5 3 8 9 0 4 0 0.25 0.99 53 E -1 -2 0 4 -4 2 3 -4 0 -3 0 0 0 0 -3 -1 -1 -4 -3 -3 6 1 4 22 0 11 21 0 2 0 13 4 2 5 0 4 3 0 0 0 0.41 0.96 54 G -2 -2 5 4 -5 -2 1 3 -3 -5 -5 -3 -4 -5 -4 0 -2 -5 -5 -3 3 1 31 21 0 0 8 27 0 0 0 0 0 0 0 4 2 0 0 2 0.84 0.99 55 D -2 -4 2 4 -5 -3 -1 5 -3 -5 -5 -2 -4 -5 -1 -2 -1 -5 -5 -5 0 0 8 23 0 0 3 56 0 0 0 2 0 0 2 0 3 0 0 0 1.06 0.96 56 K 1 -2 -3 -1 -4 0 -2 3 -3 -3 -4 4 -3 -2 -3 -1 0 -4 -4 2 12 0 0 3 0 3 0 21 0 0 0 30 0 2 0 3 7 0 0 16 0.47 0.97 57 S 0 2 -2 -3 -3 -1 -3 -3 2 1 -3 1 -3 -3 -1 3 3 4 -1 0 5 11 0 0 0 2 0 0 4 8 1 9 0 0 3 25 17 6 2 5 0.39 0.97 58 F 3 -4 -4 -4 -3 -3 -4 -3 -4 0 -3 -4 -3 4 -2 1 2 6 -2 1 25 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 18 2 11 13 13 0 12 0.62 0.99 59 Y -3 1 -2 3 -4 2 -2 -4 -1 -2 1 2 -3 0 -4 -2 -1 2 4 -2 0 7 0 21 0 10 0 0 1 1 13 16 0 3 0 2 3 2 16 2 0.44 0.96 60 F 1 -4 -4 -4 -3 -4 -4 0 -3 1 0 -4 -2 5 -4 -1 -2 -2 4 2 14 0 0 0 0 0 0 8 0 8 8 0 0 24 0 5 2 0 14 14 0.51 0.95 61 D -1 0 -3 4 -4 -1 -1 -2 2 -1 -2 1 0 0 -1 -3 0 -5 -3 3 4 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