Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 K -3 4 -3 -3 -6 -1 -2 -4 -3 -5 -5 7 -4 -6 -4 -3 -3 -5 -4 -5 0 18 0 0 0 0 0 0 0 0 0 82 0 0 0 0 0 0 0 0 1.65 1.15 2 I 4 -4 -1 2 -4 -2 0 -3 -4 0 -4 2 -1 1 -3 -1 1 -5 -4 -3 35 0 3 11 0 1 7 1 0 6 0 12 1 7 1 3 11 0 0 1 0.48 1.52 3 E -3 -2 -2 2 -6 2 6 -4 -2 -6 -6 3 -5 -6 -4 -1 -1 -6 -5 -5 1 1 1 9 0 9 51 1 1 0 0 20 0 0 0 5 3 0 0 0 1.14 1.60 4 E -3 -2 -1 4 -6 1 4 -2 -4 -6 -6 3 -5 -6 2 -2 -2 -6 -4 -3 1 1 3 26 0 7 23 3 0 0 0 18 0 0 11 2 2 0 0 2 0.82 1.73 5 G 0 -3 -3 -2 -5 -3 -1 5 -5 0 -3 -1 -4 -5 -5 -3 0 -6 -4 4 8 1 1 2 0 1 4 39 0 4 2 4 0 0 0 1 6 0 0 28 0.76 1.77 6 K -2 1 -1 0 -5 0 3 -5 -3 -4 -5 3 -5 -6 -2 -1 5 -6 -5 -4 2 6 3 5 0 4 22 0 0 0 0 17 0 0 2 3 36 0 0 0 0.83 1.83 7 L -4 -6 -6 -7 -4 -6 -6 -7 -6 5 4 -4 0 -3 -6 -5 -2 -5 -4 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32 47 1 2 0 0 0 2 0 0 16 1.21 1.83 8 V -2 1 -1 -3 -5 1 -1 -4 -3 -1 -2 1 -2 -5 -4 -1 6 -2 -4 1 2 8 2 1 0 5 3 1 0 3 4 7 1 0 0 3 47 1 0 11 0.75 1.84 9 I -4 -6 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -4 4 2 -5 3 4 -6 -5 -2 2 -1 4 1 0 0 1 0 0 0 1 0 23 15 0 7 16 0 0 2 3 2 28 0.93 1.82 10 W -1 -5 -4 -6 -5 -5 -5 -4 -4 -5 -1 -4 -1 -1 -4 -4 -3 12 1 -4 7 0 1 0 0 0 0 1 0 0 6 1 1 1 1 1 2 72 3 1 2.85 1.83 11 I 0 -4 -2 -2 -2 -3 -1 -2 5 0 -1 -3 -1 -1 -4 0 3 1 1 2 9 0 2 3 1 1 4 3 16 6 6 1 2 3 1 5 17 2 5 13 0.39 1.79 12 N 1 -1 3 2 -5 0 -2 1 1 -3 -4 -2 3 -1 0 2 -2 0 -2 0 11 4 13 11 0 4 2 9 4 1 1 1 7 3 5 14 2 1 1 7 0.26 1.81 13 G 0 -3 2 -1 -5 1 -1 3 -4 -3 -2 -1 3 -3 1 1 1 4 -2 -2 8 1 8 3 0 5 4 20 0 1 3 3 8 1 6 9 9 6 1 3 0.32 1.84 14 D 0 -4 3 4 -5 0 2 2 -1 -4 -5 0 -5 -6 0 0 -1 -6 -2 -4 8 0 14 23 0 3 12 15 2 1 1 5 0 0 5 5 3 0 1 1 0.53 1.85 15 K 0 -1 1 -1 -5 1 1 1 -2 -4 -4 2 -4 -5 4 0 -1 -4 -3 -2 8 3 7 3 0 6 11 11 1 0 1 13 0 0 19 8 4 0 1 3 0.41 1.87 16 G 1 -2 1 1 -5 2 2 1 -2 -2 -4 -2 0 -2 -3 0 0 2 0 -2 14 2 7 8 0 10 12 12 1 3 1 1 3 2 1 7 6 3 4 3 0.25 1.89 17 Y 0 -1 -2 -2 -4 0 -1 -1 -1 0 1 -1 3 2 -3 -2 0 1 3 0 9 3 2 2 0 4 4 4 2 5 12 4 8 9 1 3 7 2 11 7 0.20 1.83 18 N -1 -1 2 3 -6 2 2 -1 -2 0 -5 3 -3 -6 -1 -1 0 -4 -5 -3 5 3 11 17 0 8 14 4 1 5 0 19 0 0 3 3 5 0 0 2 0.47 1.89 19 G 2 -1 -1 -1 -5 0 1 0 -4 0 -2 0 0 0 -1 -1 -1 2 2 0 20 4 3 3 0 4 10 8 0 5 3 5 2 4 3 4 4 3 7 8 0.16 1.91 20 L -2 -4 -5 -4 -2 -3 -3 -6 -3 2 4 -3 4 1 -4 -4 -1 4 1 1 3 1 0 1 1 1 2 0 1 13 35 1 11 6 1 1 3 6 5 8 0.67 1.91 21 A 1 0 0 0 -4 3 2 -4 -4 1 -2 2 0 -4 -3 -2 -1 -6 -1 1 11 5 5 5 0 15 11 1 0 8 3 14 2 0 1 1 3 0 2 12 0.32 1.91 22 E 1 1 0 2 -6 1 3 -1 -1 -4 -3 2 -5 -5 -1 0 -1 -6 -2 -4 13 6 5 13 0 6 18 6 1 1 3 15 0 0 3 5 4 0 1 1 0.39 1.91 23 V 1 0 -3 0 -3 0 0 -3 -5 2 2 -1 3 -2 -5 -2 -1 -2 -2 1 13 5 1 6 1 4 5 2 0 12 19 3 6 2 0 3 4 1 2 10 0.23 1.91 24 G 2 -5 -4 -5 -3 -4 -5 -3 -5 3 -1 -3 -2 5 -6 -2 -1 1 1 2 20 0 0 1 0 1 0 2 0 18 6 2 1 22 0 3 3 2 4 16 0.64 1.91 25 K 2 -1 3 2 -5 1 3 -2 -3 -5 -5 3 -2 -6 -1 -1 -2 -6 -5 -5 16 2 12 12 0 5 22 2 0 0 0 19 1 0 3 3 2 0 0 0 0.61 1.92 26 K 3 1 -2 2 -5 2 3 -2 -3 -4 -3 3 -4 -4 -3 -2 -2 -4 -3 -4 23 6 2 11 0 7 18 2 0 1 2 19 0 1 1 2 2 0 1 1 0.54 1.92 27 F 0 -3 -3 -4 -3 -4 -1 -5 -4 -4 -3 -1 -3 7 -5 -2 -1 4 3 -4 9 1 1 1 0 1 5 0 0 0 1 4 0 55 0 3 3 6 9 0 1.32 1.91 28 E -2 -3 4 -2 -6 1 5 -3 5 -6 -6 -1 -3 -4 -5 -2 0 -6 0 -5 2 0 20 0 0 6 40 1 15 0 0 2 1 1 0 1 6 0 3 0 1.07 1.91 29 K 2 -1 -3 -1 -6 0 2 -4 -4 -5 -6 5 -4 -6 4 -1 -4 -6 -5 -5 15 2 1 3 0 3 11 0 0 0 0 35 0 0 24 4 0 0 0 0 0.96 1.92 30 D -2 -2 4 4 -5 2 2 -1 3 -6 -4 1 -3 -6 -5 -2 -3 -3 -2 -6 3 1 23 20 0 10 15 4 7 0 1 9 0 0 0 2 1 0 2 0 0.75 1.93 31 T -2 -4 0 -2 -5 -2 -2 -5 1 2 -3 -2 -3 -4 5 -1 3 -1 -1 1 2 0 6 2 0 2 2 0 4 12 1 2 0 1 27 5 20 1 3 10 0.66 1.91 32 G -3 -1 2 3 -6 0 0 4 -1 -6 -6 2 -5 -4 -4 -3 0 -4 -5 -4 1 3 10 17 0 4 6 34 1 0 0 12 0 1 1 1 7 0 0 1 0.74 1.91 33 I -2 -5 -2 -5 -4 -4 -5 -5 -1 6 -1 -4 -1 -2 -5 -4 -2 -2 2 4 2 0 2 0 0 1 0 1 1 42 4 1 1 1 0 0 1 1 6 34 1.09 1.92 34 K -4 1 1 1 -6 1 2 -4 0 -5 -5 5 -4 -6 -4 -2 2 -6 -4 -3 1 7 6 7 0 5 13 0 3 0 0 43 0 0 1 2 11 0 0 2 0.86 1.92 35 V -1 -4 -6 -6 -4 -3 -5 -6 -5 4 0 -5 1 0 -3 -5 -2 3 -1 6 4 1 0 0 0 1 0 0 0 20 7 0 3 3 1 0 1 4 2 51 1.06 1.92 36 T -4 -1 2 0 -5 2 3 -5 -3 -2 -3 3 -3 -6 -5 -1 2 -6 -5 2 0 2 11 4 0 9 20 0 0 2 2 16 0 0 0 3 15 0 0 15 0.57 1.92 37 V 0 -3 -2 -1 -4 -1 -2 -3 -2 2 1 -4 -1 2 1 -2 -1 0 2 3 8 1 2 4 0 3 2 2 1 11 14 1 1 8 7 3 3 1 6 21 0.28 1.93 38 E -2 -2 -1 -2 -5 2 3 -4 -5 2 0 -1 0 -1 -5 0 1 -6 -2 3 3 2 3 1 0 9 18 1 0 11 8 3 2 2 0 6 10 0 1 19 0.36 1.92 39 H -1 -3 0 0 -5 0 1 -1 -1 -5 -4 -3 -1 1 4 0 1 0 3 -1 6 1 4 5 0 5 10 4 1 0 1 1 2 7 23 8 8 2 9 5 0.43 1.92 40 P -1 -3 1 -2 -5 1 -1 -1 -1 -2 -2 1 -3 1 2 -1 0 6 3 1 6 1 8 3 0 6 4 5 2 3 3 8 0 5 9 5 5 11 8 9 0.32 1.92 41 D 0 -4 2 4 -4 -1 1 3 -4 -4 -6 -2 -5 -5 1 1 -1 -6 -3 -3 8 0 8 21 0 3 10 23 0 1 0 3 0 0 8 9 4 0 1 1 0.56 1.91 42 K 1 -3 2 3 -5 2 1 0 -3 -4 -3 0 0 -4 -2 1 0 3 -4 -1 10 1 9 18 0 10 8 6 0 1 2 5 2 1 2 12 6 4 0 4 0.35 1.91 43 L 0 -4 0 -2 -2 -1 -2 -4 -1 0 1 -5 2 1 -4 -1 0 -3 6 -1 9 1 5 2 1 3 2 1 1 6 14 0 6 6 1 5 5 0 28 5 0.54 1.92 44 E -1 1 0 2 -6 2 2 -2 2 -2 -2 1 -1 0 -2 -1 0 3 2 -2 4 8 5 13 0 8 11 3 4 3 3 8 2 5 2 4 6 4 6 2 0.22 1.90 45 E 1 -2 0 3 -5 4 3 -3 -3 -4 -3 0 -3 -6 -3 0 2 -6 -4 -4 10 1 4 17 0 19 17 2 0 1 2 5 1 0 1 7 12 0 1 1 0.57 1.91 46 K -1 3 -1 -2 -6 2 0 -4 -4 -4 -4 6 -1 -5 -5 -1 1 -4 -5 -2 6 12 3 2 0 9 4 1 0 1 2 44 1 0 0 4 8 0 0 3 0.82 1.92 47 F -2 -5 -5 -5 -5 -3 -5 -6 -6 3 4 -5 2 2 -5 -3 -1 -2 0 1 3 0 0 1 0 1 0 0 0 18 43 0 4 9 0 1 3 1 4 10 0.81 1.93 48 P 0 1 1 -1 -5 2 -1 -3 -4 -1 1 1 -1 -4 0 1 2 -6 -3 0 9 7 6 3 0 11 3 1 0 3 13 10 1 0 4 8 14 0 1 5 0.23 1.92 49 Q 2 -1 0 -3 -5 2 -2 -4 -4 -1 0 -2 -1 -5 -3 0 5 -6 -5 0 18 3 5 1 0 8 2 1 0 2 10 1 1 0 1 6 35 0 0 5 0.57 1.92 50 V 4 -1 -3 2 -5 1 -1 0 -3 -3 -1 -2 2 -2 -4 0 -2 -3 -3 -2 34 4 1 13 0 7 3 8 0 1 7 2 5 2 0 7 1 0 1 2 0.43 1.91 51 A 2 -5 -3 -5 -1 -2 -5 -2 -2 4 2 -3 2 2 -5 -2 -2 -5 -1 1 20 0 1 0 1 2 0 4 1 20 19 1 6 7 0 3 2 0 2 11 0.49 1.91 52 A 4 -1 -2 -2 -5 2 -2 -1 -3 -2 -2 -1 -1 -4 0 2 0 -6 -5 -1 38 3 2 3 0 10 2 5 0 2 4 3 1 0 5 12 5 0 0 5 0.47 1.91 53 T 4 -3 -3 -3 -4 -2 -3 3 -2 -5 -5 -1 -3 -6 -2 3 2 -6 -3 -2 31 1 1 1 0 1 1 19 1 0 0 3 0 0 2 23 12 0 1 2 0.69 1.90 54 G -2 -2 3 -1 -6 -3 -2 6 -3 -6 -6 1 -5 -5 -4 -1 -3 -6 -6 -6 2 2 12 4 0 1 2 61 0 0 0 8 0 0 1 5 1 0 0 0 1.24 1.88 55 D -1 -1 3 2 -5 2 1 1 -2 -4 -6 2 -5 -6 -5 1 2 -6 -4 -3 6 4 15 11 0 9 10 9 1 1 0 11 0 0 0 10 13 0 0 2 0.47 1.90 56 G 3 -3 -4 -2 -3 -1 -3 3 -4 -2 1 -4 0 -4 2 -1 -1 -6 -4 -1 27 1 0 3 1 2 2 21 0 2 15 0 2 0 12 4 3 0 1 4 0.48 1.89 57 P 0 -5 -4 -2 -2 -2 -4 -4 -5 -3 -5 -4 -4 -2 8 -2 -4 -6 1 -3 6 0 0 2 1 2 1 1 0 2 1 0 0 2 72 2 0 0 6 2 1.93 1.91 58 D -2 -5 -1 8 -2 -2 -2 -4 0 -5 -7 -4 -5 -6 -5 -3 -2 -2 -4 -5 4 0 1 82 1 1 1 1 2 1 0 0 0 0 0 1 3 1 1 1 1.93 1.92 59 I -1 -6 -6 -5 0 -6 -6 -5 -6 5 1 -6 1 -2 -6 -5 -2 -6 -5 5 4 0 0 0 2 0 0 1 0 28 14 0 3 1 0 0 1 0 0 45 1.16 1.91 60 I 1 -6 -6 -5 -2 -5 -6 -4 -3 3 1 -5 3 4 -6 -3 -2 -2 1 3 11 0 0 0 1 0 0 2 0 13 13 0 8 19 0 2 2 1 4 23 0.70 1.91 61 F -1 -1 1 -2 -4 3 0 -2 0 1 -1 -4 3 1 -4 -2 1 3 2 0 4 3 6 3 0 14 6 3 2 7 6 0 8 6 0 3 10 4 7 8 0.27 1.90 62 W -1 -5 -2 -3 -3 -2 -4 -2 -5 3 2 -5 4 1 -5 -2 -1 6 0 2 4 0 2 2 0 2 1 3 0 18 16 0 11 6 0 3 4 10 3 16 0.58 1.91 63 A 0 -5 1 4 -6 -2 0 2 0 -5 -4 -3 -4 -1 2 0 -1 1 1 -5 9 0 8 22 0 1 6 17 2 0 2 1 0 3 11 5 3 2 4 0 0.48 1.90 64 H 0 -3 3 0 -4 -2 0 1 4 -2 -2 -4 0 -2 1 1 0 -2 1 0 8 1 12 5 0 1 5 11 9 2 3 0 3 2 6 10 7 1 5 8 0.22 1.91 65 D -1 -2 0 3 -4 0 -1 1 -2 0 -3 -4 -2 0 1 0 1 -5 2 0 6 2 5 17 0 4 4 10 1 6 2 0 1 4 7 6 11 0 7 7 0.23 1.90 66 R -1 2 1 0 -6 1 1 0 -2 -3 -3 -1 -1 1 -4 -1 -1 8 0 -2 4 11 6 6 0 7 9 7 1 1 3 2 2 6 1 4 4 19 3 3 0.54 1.90 67 F 1 -5 -3 -5 -5 -3 -5 -3 -4 3 2 -4 3 2 -1 -3 2 0 0 1 12 0 1 0 0 1 0 2 0 15 20 0 6 9 3 1 12 1 4 10 0.44 1.91 68 G 2 -1 -2 -3 -5 0 -2 4 -3 -3 -3 -1 -2 -2 4 0 -1 -2 -1 -2 19 3 2 1 0 4 2 27 1 1 3 3 1 2 18 5 3 1 2 2 0.51 1.91 69 G 0 0 1 1 -5 4 2 -1 -3 0 -1 0 1 -2 0 -1 0 -3 -2 -2 7 4 6 7 0 16 13 6 0 5 7 5 3 1 5 4 6 0 1 2 0.21 1.91 70 Y -2 -4 -5 -4 -5 -2 -5 -5 -1 -1 2 -5 3 5 -6 -4 -4 5 5 -1 4 1 0 1 0 2 0 0 1 2 22 0 8 27 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